Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
U2af2P26369 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
U2af2P26369 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
U2af2P26369 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
U2af2P26369 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
U2af2P26369 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
U2af2P26369 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
U2af2P26369 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
U2af2P26369 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
U2af2P26369 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
U2af2P26369 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
U2af2P26369 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
U2af2P26369 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
U2af2P26369 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
U2af2P26369 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
U2af2P26369 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
U2af2P26369 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
U2af2P26369 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28■■■□□ 2.07
U2af2P26369 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
U2af2P26369 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
U2af2P26369 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
U2af2P26369 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
U2af2P26369 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
U2af2P26369 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
U2af2P26369 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
U2af2P26369 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
U2af2P26369 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
U2af2P26369 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
U2af2P26369 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
U2af2P26369 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
U2af2P26369 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
U2af2P26369 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
U2af2P26369 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
U2af2P26369 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
U2af2P26369 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
U2af2P26369 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
U2af2P26369 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
U2af2P26369 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
U2af2P26369 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
U2af2P26369 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
U2af2P26369 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
U2af2P26369 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
U2af2P26369 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
U2af2P26369 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
U2af2P26369 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
U2af2P26369 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
U2af2P26369 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
U2af2P26369 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
U2af2P26369 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
U2af2P26369 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
U2af2P26369 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
U2af2P26369 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
U2af2P26369 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
U2af2P26369 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
U2af2P26369 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
U2af2P26369 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
U2af2P26369 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
U2af2P26369 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
U2af2P26369 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
U2af2P26369 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
U2af2P26369 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
U2af2P26369 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
U2af2P26369 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
U2af2P26369 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
U2af2P26369 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
U2af2P26369 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
U2af2P26369 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
U2af2P26369 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
U2af2P26369 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
U2af2P26369 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
U2af2P26369 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
U2af2P26369 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
U2af2P26369 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
U2af2P26369 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
U2af2P26369 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
U2af2P26369 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
U2af2P26369 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
U2af2P26369 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
U2af2P26369 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
U2af2P26369 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
U2af2P26369 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
U2af2P26369 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
U2af2P26369 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
U2af2P26369 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
U2af2P26369 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
U2af2P26369 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
U2af2P26369 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
U2af2P26369 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
U2af2P26369 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
U2af2P26369 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
U2af2P26369 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
U2af2P26369 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
U2af2P26369 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
U2af2P26369 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
U2af2P26369 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
U2af2P26369 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
U2af2P26369 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
U2af2P26369 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
U2af2P26369 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
U2af2P26369 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.3 ms