Protein–RNA interactions for Protein: P23506

Pcmt1, Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmt1P23506 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcmt1P23506 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcmt1P23506 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcmt1P23506 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcmt1P23506 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcmt1P23506 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcmt1P23506 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcmt1P23506 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcmt1P23506 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcmt1P23506 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcmt1P23506 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcmt1P23506 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcmt1P23506 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcmt1P23506 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcmt1P23506 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcmt1P23506 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcmt1P23506 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcmt1P23506 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcmt1P23506 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcmt1P23506 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcmt1P23506 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcmt1P23506 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcmt1P23506 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcmt1P23506 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcmt1P23506 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcmt1P23506 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcmt1P23506 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcmt1P23506 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcmt1P23506 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcmt1P23506 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcmt1P23506 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcmt1P23506 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcmt1P23506 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcmt1P23506 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcmt1P23506 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcmt1P23506 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcmt1P23506 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcmt1P23506 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcmt1P23506 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcmt1P23506 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcmt1P23506 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcmt1P23506 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcmt1P23506 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcmt1P23506 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcmt1P23506 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcmt1P23506 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcmt1P23506 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcmt1P23506 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcmt1P23506 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcmt1P23506 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcmt1P23506 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcmt1P23506 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcmt1P23506 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcmt1P23506 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcmt1P23506 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcmt1P23506 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcmt1P23506 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcmt1P23506 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcmt1P23506 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcmt1P23506 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcmt1P23506 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcmt1P23506 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcmt1P23506 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcmt1P23506 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcmt1P23506 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcmt1P23506 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcmt1P23506 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcmt1P23506 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcmt1P23506 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcmt1P23506 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcmt1P23506 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcmt1P23506 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcmt1P23506 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcmt1P23506 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcmt1P23506 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcmt1P23506 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcmt1P23506 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcmt1P23506 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcmt1P23506 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcmt1P23506 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcmt1P23506 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcmt1P23506 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcmt1P23506 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcmt1P23506 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcmt1P23506 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcmt1P23506 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcmt1P23506 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcmt1P23506 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcmt1P23506 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcmt1P23506 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcmt1P23506 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcmt1P23506 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcmt1P23506 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcmt1P23506 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcmt1P23506 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcmt1P23506 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcmt1P23506 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcmt1P23506 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcmt1P23506 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcmt1P23506 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms