Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
RarbP22605 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RarbP22605 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RarbP22605 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RarbP22605 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RarbP22605 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RarbP22605 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RarbP22605 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RarbP22605 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RarbP22605 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RarbP22605 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RarbP22605 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RarbP22605 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RarbP22605 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RarbP22605 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RarbP22605 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RarbP22605 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RarbP22605 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RarbP22605 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RarbP22605 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RarbP22605 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RarbP22605 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RarbP22605 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RarbP22605 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RarbP22605 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RarbP22605 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RarbP22605 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RarbP22605 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RarbP22605 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RarbP22605 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RarbP22605 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RarbP22605 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RarbP22605 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RarbP22605 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RarbP22605 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RarbP22605 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RarbP22605 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RarbP22605 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RarbP22605 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RarbP22605 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RarbP22605 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RarbP22605 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RarbP22605 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RarbP22605 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RarbP22605 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RarbP22605 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RarbP22605 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RarbP22605 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RarbP22605 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RarbP22605 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RarbP22605 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RarbP22605 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RarbP22605 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RarbP22605 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RarbP22605 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RarbP22605 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RarbP22605 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RarbP22605 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RarbP22605 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RarbP22605 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RarbP22605 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RarbP22605 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RarbP22605 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RarbP22605 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RarbP22605 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RarbP22605 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RarbP22605 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RarbP22605 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RarbP22605 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RarbP22605 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RarbP22605 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RarbP22605 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RarbP22605 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RarbP22605 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RarbP22605 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
RarbP22605 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RarbP22605 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RarbP22605 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RarbP22605 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RarbP22605 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RarbP22605 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RarbP22605 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RarbP22605 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RarbP22605 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RarbP22605 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
RarbP22605 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RarbP22605 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RarbP22605 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RarbP22605 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RarbP22605 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RarbP22605 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RarbP22605 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RarbP22605 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RarbP22605 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RarbP22605 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RarbP22605 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RarbP22605 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RarbP22605 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RarbP22605 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RarbP22605 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms