Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rps6ka1P18653 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rps6ka1P18653 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rps6ka1P18653 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rps6ka1P18653 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rps6ka1P18653 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rps6ka1P18653 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rps6ka1P18653 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rps6ka1P18653 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rps6ka1P18653 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rps6ka1P18653 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rps6ka1P18653 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rps6ka1P18653 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rps6ka1P18653 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rps6ka1P18653 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rps6ka1P18653 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rps6ka1P18653 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rps6ka1P18653 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rps6ka1P18653 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rps6ka1P18653 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rps6ka1P18653 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rps6ka1P18653 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rps6ka1P18653 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rps6ka1P18653 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rps6ka1P18653 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rps6ka1P18653 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rps6ka1P18653 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rps6ka1P18653 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rps6ka1P18653 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rps6ka1P18653 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rps6ka1P18653 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rps6ka1P18653 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rps6ka1P18653 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rps6ka1P18653 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rps6ka1P18653 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rps6ka1P18653 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rps6ka1P18653 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rps6ka1P18653 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rps6ka1P18653 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rps6ka1P18653 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Rps6ka1P18653 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rps6ka1P18653 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rps6ka1P18653 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rps6ka1P18653 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rps6ka1P18653 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rps6ka1P18653 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rps6ka1P18653 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Rps6ka1P18653 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rps6ka1P18653 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rps6ka1P18653 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rps6ka1P18653 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rps6ka1P18653 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rps6ka1P18653 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rps6ka1P18653 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Rps6ka1P18653 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rps6ka1P18653 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rps6ka1P18653 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rps6ka1P18653 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rps6ka1P18653 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rps6ka1P18653 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rps6ka1P18653 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rps6ka1P18653 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rps6ka1P18653 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rps6ka1P18653 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rps6ka1P18653 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rps6ka1P18653 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Rps6ka1P18653 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rps6ka1P18653 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rps6ka1P18653 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rps6ka1P18653 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rps6ka1P18653 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rps6ka1P18653 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rps6ka1P18653 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rps6ka1P18653 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rps6ka1P18653 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rps6ka1P18653 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rps6ka1P18653 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rps6ka1P18653 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rps6ka1P18653 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rps6ka1P18653 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rps6ka1P18653 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rps6ka1P18653 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rps6ka1P18653 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rps6ka1P18653 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rps6ka1P18653 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rps6ka1P18653 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rps6ka1P18653 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rps6ka1P18653 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rps6ka1P18653 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rps6ka1P18653 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rps6ka1P18653 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rps6ka1P18653 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rps6ka1P18653 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rps6ka1P18653 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rps6ka1P18653 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rps6ka1P18653 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rps6ka1P18653 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rps6ka1P18653 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rps6ka1P18653 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rps6ka1P18653 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms