Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxb1P17919 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxb1P17919 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxb1P17919 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxb1P17919 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxb1P17919 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxb1P17919 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxb1P17919 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxb1P17919 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxb1P17919 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxb1P17919 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxb1P17919 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hoxb1P17919 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxb1P17919 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxb1P17919 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxb1P17919 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxb1P17919 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxb1P17919 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxb1P17919 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxb1P17919 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxb1P17919 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxb1P17919 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxb1P17919 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxb1P17919 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxb1P17919 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxb1P17919 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxb1P17919 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxb1P17919 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxb1P17919 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxb1P17919 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxb1P17919 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxb1P17919 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxb1P17919 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxb1P17919 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxb1P17919 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxb1P17919 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxb1P17919 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxb1P17919 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxb1P17919 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxb1P17919 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxb1P17919 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxb1P17919 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxb1P17919 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Hoxb1P17919 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxb1P17919 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxb1P17919 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxb1P17919 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxb1P17919 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxb1P17919 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxb1P17919 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxb1P17919 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxb1P17919 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxb1P17919 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxb1P17919 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxb1P17919 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxb1P17919 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxb1P17919 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxb1P17919 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxb1P17919 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxb1P17919 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxb1P17919 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxb1P17919 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxb1P17919 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxb1P17919 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxb1P17919 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxb1P17919 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxb1P17919 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxb1P17919 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxb1P17919 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxb1P17919 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxb1P17919 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxb1P17919 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxb1P17919 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxb1P17919 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxb1P17919 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxb1P17919 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxb1P17919 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxb1P17919 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxb1P17919 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxb1P17919 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxb1P17919 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxb1P17919 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hoxb1P17919 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxb1P17919 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxb1P17919 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxb1P17919 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxb1P17919 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxb1P17919 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxb1P17919 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxb1P17919 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxb1P17919 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxb1P17919 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxb1P17919 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxb1P17919 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxb1P17919 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxb1P17919 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxb1P17919 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxb1P17919 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxb1P17919 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxb1P17919 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms