Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sptan1P16546 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Sptan1P16546 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sptan1P16546 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sptan1P16546 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sptan1P16546 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sptan1P16546 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sptan1P16546 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sptan1P16546 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sptan1P16546 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sptan1P16546 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sptan1P16546 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sptan1P16546 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sptan1P16546 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Sptan1P16546 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Sptan1P16546 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sptan1P16546 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Sptan1P16546 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Sptan1P16546 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sptan1P16546 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sptan1P16546 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sptan1P16546 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sptan1P16546 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sptan1P16546 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sptan1P16546 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sptan1P16546 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sptan1P16546 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sptan1P16546 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sptan1P16546 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sptan1P16546 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sptan1P16546 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sptan1P16546 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Sptan1P16546 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Sptan1P16546 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sptan1P16546 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sptan1P16546 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sptan1P16546 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sptan1P16546 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sptan1P16546 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sptan1P16546 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sptan1P16546 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sptan1P16546 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sptan1P16546 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Sptan1P16546 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sptan1P16546 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sptan1P16546 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sptan1P16546 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sptan1P16546 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sptan1P16546 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sptan1P16546 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sptan1P16546 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sptan1P16546 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Sptan1P16546 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sptan1P16546 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sptan1P16546 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sptan1P16546 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sptan1P16546 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sptan1P16546 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sptan1P16546 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sptan1P16546 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sptan1P16546 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sptan1P16546 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sptan1P16546 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sptan1P16546 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sptan1P16546 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sptan1P16546 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sptan1P16546 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sptan1P16546 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sptan1P16546 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Sptan1P16546 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sptan1P16546 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sptan1P16546 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sptan1P16546 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sptan1P16546 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sptan1P16546 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sptan1P16546 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sptan1P16546 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sptan1P16546 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sptan1P16546 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sptan1P16546 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sptan1P16546 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sptan1P16546 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sptan1P16546 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Sptan1P16546 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sptan1P16546 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sptan1P16546 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sptan1P16546 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sptan1P16546 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sptan1P16546 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sptan1P16546 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sptan1P16546 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sptan1P16546 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sptan1P16546 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sptan1P16546 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sptan1P16546 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sptan1P16546 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sptan1P16546 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sptan1P16546 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Sptan1P16546 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sptan1P16546 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.5 ms