Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lamp1P11438 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lamp1P11438 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lamp1P11438 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lamp1P11438 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lamp1P11438 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lamp1P11438 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lamp1P11438 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lamp1P11438 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lamp1P11438 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Lamp1P11438 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lamp1P11438 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lamp1P11438 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lamp1P11438 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lamp1P11438 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lamp1P11438 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lamp1P11438 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lamp1P11438 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lamp1P11438 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lamp1P11438 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lamp1P11438 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Lamp1P11438 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lamp1P11438 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lamp1P11438 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lamp1P11438 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lamp1P11438 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lamp1P11438 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lamp1P11438 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lamp1P11438 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lamp1P11438 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lamp1P11438 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lamp1P11438 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lamp1P11438 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lamp1P11438 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Lamp1P11438 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lamp1P11438 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lamp1P11438 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lamp1P11438 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lamp1P11438 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Lamp1P11438 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lamp1P11438 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lamp1P11438 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lamp1P11438 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Lamp1P11438 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Lamp1P11438 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lamp1P11438 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lamp1P11438 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lamp1P11438 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lamp1P11438 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lamp1P11438 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lamp1P11438 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lamp1P11438 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lamp1P11438 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lamp1P11438 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lamp1P11438 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lamp1P11438 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Lamp1P11438 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Lamp1P11438 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Lamp1P11438 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lamp1P11438 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lamp1P11438 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lamp1P11438 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lamp1P11438 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lamp1P11438 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lamp1P11438 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Lamp1P11438 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Lamp1P11438 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lamp1P11438 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lamp1P11438 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lamp1P11438 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lamp1P11438 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lamp1P11438 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lamp1P11438 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lamp1P11438 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lamp1P11438 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lamp1P11438 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lamp1P11438 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lamp1P11438 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lamp1P11438 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lamp1P11438 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lamp1P11438 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lamp1P11438 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Lamp1P11438 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Lamp1P11438 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lamp1P11438 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lamp1P11438 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lamp1P11438 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lamp1P11438 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Lamp1P11438 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Lamp1P11438 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lamp1P11438 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lamp1P11438 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lamp1P11438 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lamp1P11438 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Lamp1P11438 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lamp1P11438 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lamp1P11438 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lamp1P11438 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lamp1P11438 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lamp1P11438 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms