Protein–RNA interactions for Protein: P11088

Flg, Filaggrin (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FlgP11088 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FlgP11088 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FlgP11088 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FlgP11088 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FlgP11088 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FlgP11088 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FlgP11088 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FlgP11088 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FlgP11088 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FlgP11088 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FlgP11088 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FlgP11088 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FlgP11088 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FlgP11088 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FlgP11088 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FlgP11088 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FlgP11088 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FlgP11088 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FlgP11088 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FlgP11088 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FlgP11088 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FlgP11088 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FlgP11088 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FlgP11088 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FlgP11088 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FlgP11088 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FlgP11088 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FlgP11088 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FlgP11088 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FlgP11088 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FlgP11088 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
FlgP11088 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FlgP11088 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
FlgP11088 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
FlgP11088 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FlgP11088 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FlgP11088 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FlgP11088 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FlgP11088 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FlgP11088 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FlgP11088 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FlgP11088 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FlgP11088 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FlgP11088 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FlgP11088 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FlgP11088 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
FlgP11088 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FlgP11088 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FlgP11088 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FlgP11088 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FlgP11088 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FlgP11088 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
FlgP11088 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FlgP11088 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FlgP11088 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FlgP11088 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FlgP11088 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FlgP11088 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FlgP11088 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FlgP11088 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FlgP11088 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FlgP11088 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FlgP11088 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FlgP11088 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FlgP11088 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FlgP11088 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FlgP11088 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FlgP11088 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FlgP11088 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FlgP11088 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FlgP11088 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FlgP11088 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FlgP11088 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FlgP11088 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FlgP11088 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FlgP11088 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FlgP11088 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FlgP11088 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FlgP11088 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FlgP11088 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FlgP11088 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FlgP11088 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FlgP11088 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
FlgP11088 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FlgP11088 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FlgP11088 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
FlgP11088 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FlgP11088 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FlgP11088 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FlgP11088 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
FlgP11088 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FlgP11088 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FlgP11088 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FlgP11088 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
FlgP11088 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
FlgP11088 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FlgP11088 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FlgP11088 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FlgP11088 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FlgP11088 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms