Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nid1P10493 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nid1P10493 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nid1P10493 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nid1P10493 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nid1P10493 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nid1P10493 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nid1P10493 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Nid1P10493 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nid1P10493 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nid1P10493 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nid1P10493 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nid1P10493 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nid1P10493 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nid1P10493 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nid1P10493 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nid1P10493 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nid1P10493 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nid1P10493 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nid1P10493 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nid1P10493 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nid1P10493 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nid1P10493 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nid1P10493 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nid1P10493 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nid1P10493 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nid1P10493 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nid1P10493 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nid1P10493 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nid1P10493 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nid1P10493 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nid1P10493 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nid1P10493 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nid1P10493 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nid1P10493 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nid1P10493 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nid1P10493 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nid1P10493 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nid1P10493 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Nid1P10493 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nid1P10493 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nid1P10493 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nid1P10493 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nid1P10493 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nid1P10493 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nid1P10493 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nid1P10493 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nid1P10493 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nid1P10493 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nid1P10493 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nid1P10493 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nid1P10493 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nid1P10493 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Nid1P10493 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nid1P10493 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nid1P10493 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nid1P10493 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nid1P10493 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nid1P10493 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Nid1P10493 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nid1P10493 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nid1P10493 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nid1P10493 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nid1P10493 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nid1P10493 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nid1P10493 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nid1P10493 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nid1P10493 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nid1P10493 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nid1P10493 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nid1P10493 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nid1P10493 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Nid1P10493 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Nid1P10493 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nid1P10493 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nid1P10493 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nid1P10493 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nid1P10493 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nid1P10493 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nid1P10493 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nid1P10493 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nid1P10493 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nid1P10493 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Nid1P10493 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nid1P10493 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nid1P10493 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nid1P10493 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nid1P10493 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Nid1P10493 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nid1P10493 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nid1P10493 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nid1P10493 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nid1P10493 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nid1P10493 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nid1P10493 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nid1P10493 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nid1P10493 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nid1P10493 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nid1P10493 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Nid1P10493 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms