Protein–RNA interactions for Protein: P0DN34

Ndufb1, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb1P0DN34 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ndufb1P0DN34 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ndufb1P0DN34 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ndufb1P0DN34 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ndufb1P0DN34 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ndufb1P0DN34 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ndufb1P0DN34 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ndufb1P0DN34 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ndufb1P0DN34 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ndufb1P0DN34 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ndufb1P0DN34 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ndufb1P0DN34 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ndufb1P0DN34 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ndufb1P0DN34 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ndufb1P0DN34 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ndufb1P0DN34 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ndufb1P0DN34 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ndufb1P0DN34 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ndufb1P0DN34 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ndufb1P0DN34 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ndufb1P0DN34 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ndufb1P0DN34 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ndufb1P0DN34 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ndufb1P0DN34 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ndufb1P0DN34 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ndufb1P0DN34 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ndufb1P0DN34 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ndufb1P0DN34 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ndufb1P0DN34 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ndufb1P0DN34 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ndufb1P0DN34 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ndufb1P0DN34 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ndufb1P0DN34 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ndufb1P0DN34 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ndufb1P0DN34 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ndufb1P0DN34 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ndufb1P0DN34 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ndufb1P0DN34 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ndufb1P0DN34 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ndufb1P0DN34 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ndufb1P0DN34 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ndufb1P0DN34 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ndufb1P0DN34 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ndufb1P0DN34 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ndufb1P0DN34 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ndufb1P0DN34 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ndufb1P0DN34 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ndufb1P0DN34 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ndufb1P0DN34 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ndufb1P0DN34 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ndufb1P0DN34 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ndufb1P0DN34 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ndufb1P0DN34 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ndufb1P0DN34 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ndufb1P0DN34 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ndufb1P0DN34 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ndufb1P0DN34 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ndufb1P0DN34 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ndufb1P0DN34 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ndufb1P0DN34 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ndufb1P0DN34 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ndufb1P0DN34 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ndufb1P0DN34 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ndufb1P0DN34 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ndufb1P0DN34 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ndufb1P0DN34 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ndufb1P0DN34 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ndufb1P0DN34 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ndufb1P0DN34 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ndufb1P0DN34 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ndufb1P0DN34 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ndufb1P0DN34 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ndufb1P0DN34 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ndufb1P0DN34 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ndufb1P0DN34 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ndufb1P0DN34 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ndufb1P0DN34 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ndufb1P0DN34 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ndufb1P0DN34 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ndufb1P0DN34 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ndufb1P0DN34 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ndufb1P0DN34 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ndufb1P0DN34 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ndufb1P0DN34 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ndufb1P0DN34 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ndufb1P0DN34 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ndufb1P0DN34 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ndufb1P0DN34 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ndufb1P0DN34 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ndufb1P0DN34 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ndufb1P0DN34 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ndufb1P0DN34 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ndufb1P0DN34 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ndufb1P0DN34 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ndufb1P0DN34 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndufb1P0DN34 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndufb1P0DN34 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndufb1P0DN34 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndufb1P0DN34 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndufb1P0DN34 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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