Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprqP0C5E4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprqP0C5E4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprqP0C5E4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprqP0C5E4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprqP0C5E4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprqP0C5E4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprqP0C5E4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprqP0C5E4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprqP0C5E4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprqP0C5E4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprqP0C5E4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprqP0C5E4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprqP0C5E4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprqP0C5E4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprqP0C5E4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprqP0C5E4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprqP0C5E4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprqP0C5E4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprqP0C5E4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprqP0C5E4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprqP0C5E4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprqP0C5E4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprqP0C5E4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprqP0C5E4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprqP0C5E4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprqP0C5E4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprqP0C5E4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprqP0C5E4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprqP0C5E4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprqP0C5E4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprqP0C5E4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprqP0C5E4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprqP0C5E4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprqP0C5E4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprqP0C5E4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprqP0C5E4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprqP0C5E4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprqP0C5E4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprqP0C5E4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprqP0C5E4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprqP0C5E4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprqP0C5E4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprqP0C5E4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprqP0C5E4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprqP0C5E4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprqP0C5E4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprqP0C5E4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprqP0C5E4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprqP0C5E4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprqP0C5E4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprqP0C5E4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprqP0C5E4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprqP0C5E4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprqP0C5E4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprqP0C5E4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprqP0C5E4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprqP0C5E4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprqP0C5E4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprqP0C5E4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprqP0C5E4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprqP0C5E4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprqP0C5E4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprqP0C5E4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprqP0C5E4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprqP0C5E4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprqP0C5E4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprqP0C5E4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprqP0C5E4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprqP0C5E4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprqP0C5E4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PtprqP0C5E4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PtprqP0C5E4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprqP0C5E4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprqP0C5E4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprqP0C5E4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprqP0C5E4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprqP0C5E4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprqP0C5E4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprqP0C5E4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprqP0C5E4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprqP0C5E4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprqP0C5E4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprqP0C5E4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprqP0C5E4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprqP0C5E4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprqP0C5E4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprqP0C5E4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprqP0C5E4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprqP0C5E4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprqP0C5E4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprqP0C5E4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprqP0C5E4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprqP0C5E4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprqP0C5E4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprqP0C5E4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprqP0C5E4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprqP0C5E4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprqP0C5E4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprqP0C5E4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms