Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ifna9P09235 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ifna9P09235 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ifna9P09235 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ifna9P09235 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ifna9P09235 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ifna9P09235 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ifna9P09235 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ifna9P09235 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ifna9P09235 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ifna9P09235 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifna9P09235 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifna9P09235 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ifna9P09235 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ifna9P09235 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ifna9P09235 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ifna9P09235 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ifna9P09235 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ifna9P09235 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifna9P09235 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ifna9P09235 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ifna9P09235 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ifna9P09235 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ifna9P09235 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ifna9P09235 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ifna9P09235 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ifna9P09235 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ifna9P09235 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ifna9P09235 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ifna9P09235 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ifna9P09235 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ifna9P09235 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ifna9P09235 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ifna9P09235 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ifna9P09235 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ifna9P09235 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ifna9P09235 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ifna9P09235 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ifna9P09235 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ifna9P09235 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ifna9P09235 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ifna9P09235 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ifna9P09235 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ifna9P09235 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ifna9P09235 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ifna9P09235 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ifna9P09235 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ifna9P09235 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ifna9P09235 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ifna9P09235 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ifna9P09235 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ifna9P09235 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ifna9P09235 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ifna9P09235 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ifna9P09235 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ifna9P09235 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ifna9P09235 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ifna9P09235 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ifna9P09235 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ifna9P09235 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ifna9P09235 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ifna9P09235 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ifna9P09235 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ifna9P09235 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ifna9P09235 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ifna9P09235 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ifna9P09235 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ifna9P09235 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ifna9P09235 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ifna9P09235 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ifna9P09235 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ifna9P09235 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ifna9P09235 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ifna9P09235 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ifna9P09235 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ifna9P09235 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ifna9P09235 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ifna9P09235 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ifna9P09235 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ifna9P09235 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ifna9P09235 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ifna9P09235 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ifna9P09235 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ifna9P09235 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ifna9P09235 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ifna9P09235 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ifna9P09235 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ifna9P09235 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ifna9P09235 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ifna9P09235 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ifna9P09235 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ifna9P09235 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ifna9P09235 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ifna9P09235 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ifna9P09235 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ifna9P09235 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ifna9P09235 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ifna9P09235 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ifna9P09235 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ifna9P09235 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms