Protein–RNA interactions for Protein: P08775

Polr2a, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2aP08775 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Polr2aP08775 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Polr2aP08775 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Polr2aP08775 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Polr2aP08775 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Polr2aP08775 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Polr2aP08775 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Polr2aP08775 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Polr2aP08775 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Polr2aP08775 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Polr2aP08775 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Polr2aP08775 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Polr2aP08775 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Polr2aP08775 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Polr2aP08775 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Polr2aP08775 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Polr2aP08775 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Polr2aP08775 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Polr2aP08775 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Polr2aP08775 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Polr2aP08775 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Polr2aP08775 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Polr2aP08775 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Polr2aP08775 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Polr2aP08775 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Polr2aP08775 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Polr2aP08775 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Polr2aP08775 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Polr2aP08775 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Polr2aP08775 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Polr2aP08775 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Polr2aP08775 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Polr2aP08775 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Polr2aP08775 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Polr2aP08775 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Polr2aP08775 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Polr2aP08775 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Polr2aP08775 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Polr2aP08775 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Polr2aP08775 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Polr2aP08775 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Polr2aP08775 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Polr2aP08775 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Polr2aP08775 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Polr2aP08775 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Polr2aP08775 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Polr2aP08775 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Polr2aP08775 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Polr2aP08775 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Polr2aP08775 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Polr2aP08775 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Polr2aP08775 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Polr2aP08775 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Polr2aP08775 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Polr2aP08775 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Polr2aP08775 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Polr2aP08775 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Polr2aP08775 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Polr2aP08775 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Polr2aP08775 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Polr2aP08775 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Polr2aP08775 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Polr2aP08775 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Polr2aP08775 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Polr2aP08775 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Polr2aP08775 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Polr2aP08775 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Polr2aP08775 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Polr2aP08775 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Polr2aP08775 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Polr2aP08775 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Polr2aP08775 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Polr2aP08775 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Polr2aP08775 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Polr2aP08775 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Polr2aP08775 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Polr2aP08775 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Polr2aP08775 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Polr2aP08775 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Polr2aP08775 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Polr2aP08775 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Polr2aP08775 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Polr2aP08775 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Polr2aP08775 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Polr2aP08775 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Polr2aP08775 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Polr2aP08775 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Polr2aP08775 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Polr2aP08775 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Polr2aP08775 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Polr2aP08775 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Polr2aP08775 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Polr2aP08775 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Polr2aP08775 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Polr2aP08775 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Polr2aP08775 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Polr2aP08775 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Polr2aP08775 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Polr2aP08775 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Polr2aP08775 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms