Protein–RNA interactions for Protein: P06879

Prl, Prolactin, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrlP06879 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PrlP06879 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PrlP06879 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PrlP06879 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PrlP06879 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PrlP06879 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PrlP06879 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PrlP06879 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PrlP06879 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PrlP06879 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PrlP06879 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PrlP06879 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PrlP06879 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PrlP06879 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PrlP06879 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PrlP06879 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PrlP06879 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PrlP06879 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PrlP06879 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PrlP06879 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PrlP06879 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PrlP06879 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PrlP06879 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PrlP06879 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PrlP06879 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PrlP06879 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PrlP06879 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PrlP06879 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PrlP06879 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PrlP06879 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PrlP06879 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PrlP06879 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PrlP06879 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PrlP06879 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PrlP06879 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PrlP06879 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PrlP06879 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PrlP06879 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PrlP06879 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PrlP06879 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PrlP06879 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PrlP06879 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PrlP06879 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PrlP06879 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PrlP06879 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PrlP06879 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PrlP06879 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PrlP06879 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PrlP06879 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
PrlP06879 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PrlP06879 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PrlP06879 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PrlP06879 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PrlP06879 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PrlP06879 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PrlP06879 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PrlP06879 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PrlP06879 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PrlP06879 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PrlP06879 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PrlP06879 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PrlP06879 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PrlP06879 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PrlP06879 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PrlP06879 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PrlP06879 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PrlP06879 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PrlP06879 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PrlP06879 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PrlP06879 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PrlP06879 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PrlP06879 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PrlP06879 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PrlP06879 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PrlP06879 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PrlP06879 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PrlP06879 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PrlP06879 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PrlP06879 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PrlP06879 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PrlP06879 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PrlP06879 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PrlP06879 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PrlP06879 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PrlP06879 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PrlP06879 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PrlP06879 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PrlP06879 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PrlP06879 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PrlP06879 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PrlP06879 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PrlP06879 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PrlP06879 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PrlP06879 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PrlP06879 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PrlP06879 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PrlP06879 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PrlP06879 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PrlP06879 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PrlP06879 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms