Protein–RNA interactions for Protein: P06796

Csn3, Kappa-casein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn3P06796 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csn3P06796 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csn3P06796 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csn3P06796 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csn3P06796 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csn3P06796 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csn3P06796 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csn3P06796 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csn3P06796 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csn3P06796 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csn3P06796 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csn3P06796 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csn3P06796 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csn3P06796 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csn3P06796 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csn3P06796 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csn3P06796 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Csn3P06796 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csn3P06796 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csn3P06796 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csn3P06796 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csn3P06796 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csn3P06796 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csn3P06796 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csn3P06796 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csn3P06796 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csn3P06796 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csn3P06796 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Csn3P06796 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Csn3P06796 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csn3P06796 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csn3P06796 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csn3P06796 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csn3P06796 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csn3P06796 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csn3P06796 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csn3P06796 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csn3P06796 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csn3P06796 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csn3P06796 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csn3P06796 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Csn3P06796 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csn3P06796 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csn3P06796 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csn3P06796 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Csn3P06796 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csn3P06796 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Csn3P06796 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Csn3P06796 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csn3P06796 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csn3P06796 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csn3P06796 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csn3P06796 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Csn3P06796 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csn3P06796 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csn3P06796 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csn3P06796 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csn3P06796 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csn3P06796 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csn3P06796 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csn3P06796 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csn3P06796 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csn3P06796 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csn3P06796 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csn3P06796 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csn3P06796 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csn3P06796 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csn3P06796 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csn3P06796 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csn3P06796 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csn3P06796 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csn3P06796 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Csn3P06796 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Csn3P06796 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Csn3P06796 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csn3P06796 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csn3P06796 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csn3P06796 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csn3P06796 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Csn3P06796 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Csn3P06796 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csn3P06796 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csn3P06796 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csn3P06796 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csn3P06796 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csn3P06796 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csn3P06796 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csn3P06796 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csn3P06796 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csn3P06796 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csn3P06796 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csn3P06796 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csn3P06796 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Csn3P06796 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csn3P06796 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csn3P06796 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csn3P06796 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csn3P06796 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csn3P06796 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csn3P06796 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms