Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Apoa4P06728 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Apoa4P06728 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Apoa4P06728 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Apoa4P06728 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Apoa4P06728 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Apoa4P06728 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Apoa4P06728 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Apoa4P06728 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Apoa4P06728 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Apoa4P06728 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Apoa4P06728 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Apoa4P06728 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Apoa4P06728 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Apoa4P06728 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Apoa4P06728 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Apoa4P06728 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Apoa4P06728 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Apoa4P06728 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Apoa4P06728 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Apoa4P06728 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Apoa4P06728 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Apoa4P06728 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Apoa4P06728 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Apoa4P06728 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Apoa4P06728 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Apoa4P06728 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Apoa4P06728 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Apoa4P06728 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Apoa4P06728 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Apoa4P06728 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Apoa4P06728 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Apoa4P06728 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Apoa4P06728 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Apoa4P06728 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Apoa4P06728 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Apoa4P06728 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Apoa4P06728 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Apoa4P06728 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apoa4P06728 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apoa4P06728 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Apoa4P06728 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Apoa4P06728 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Apoa4P06728 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Apoa4P06728 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Apoa4P06728 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Apoa4P06728 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Apoa4P06728 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Apoa4P06728 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Apoa4P06728 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apoa4P06728 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apoa4P06728 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apoa4P06728 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apoa4P06728 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Apoa4P06728 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Apoa4P06728 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Apoa4P06728 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Apoa4P06728 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Apoa4P06728 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Apoa4P06728 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Apoa4P06728 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Apoa4P06728 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Apoa4P06728 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apoa4P06728 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apoa4P06728 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apoa4P06728 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apoa4P06728 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apoa4P06728 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apoa4P06728 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apoa4P06728 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Apoa4P06728 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apoa4P06728 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Apoa4P06728 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Apoa4P06728 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Apoa4P06728 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Apoa4P06728 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apoa4P06728 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apoa4P06728 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apoa4P06728 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apoa4P06728 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apoa4P06728 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Apoa4P06728 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Apoa4P06728 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Apoa4P06728 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Apoa4P06728 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apoa4P06728 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apoa4P06728 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Apoa4P06728 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apoa4P06728 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apoa4P06728 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apoa4P06728 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apoa4P06728 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apoa4P06728 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apoa4P06728 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Apoa4P06728 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Apoa4P06728 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Apoa4P06728 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apoa4P06728 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Apoa4P06728 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Apoa4P06728 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms