Protein–RNA interactions for Protein: P05531

Xlr, X-linked lymphocyte-regulated protein PM1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XlrP05531 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
XlrP05531 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
XlrP05531 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
XlrP05531 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
XlrP05531 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
XlrP05531 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
XlrP05531 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
XlrP05531 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
XlrP05531 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
XlrP05531 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
XlrP05531 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
XlrP05531 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
XlrP05531 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
XlrP05531 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
XlrP05531 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
XlrP05531 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
XlrP05531 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
XlrP05531 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
XlrP05531 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
XlrP05531 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
XlrP05531 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
XlrP05531 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
XlrP05531 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
XlrP05531 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
XlrP05531 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
XlrP05531 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
XlrP05531 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
XlrP05531 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
XlrP05531 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
XlrP05531 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
XlrP05531 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
XlrP05531 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
XlrP05531 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
XlrP05531 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
XlrP05531 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
XlrP05531 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
XlrP05531 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
XlrP05531 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
XlrP05531 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
XlrP05531 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
XlrP05531 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
XlrP05531 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
XlrP05531 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
XlrP05531 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
XlrP05531 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
XlrP05531 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
XlrP05531 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
XlrP05531 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
XlrP05531 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
XlrP05531 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
XlrP05531 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
XlrP05531 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
XlrP05531 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
XlrP05531 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
XlrP05531 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
XlrP05531 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
XlrP05531 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
XlrP05531 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
XlrP05531 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
XlrP05531 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
XlrP05531 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
XlrP05531 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
XlrP05531 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
XlrP05531 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
XlrP05531 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
XlrP05531 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
XlrP05531 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
XlrP05531 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
XlrP05531 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
XlrP05531 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
XlrP05531 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
XlrP05531 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
XlrP05531 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
XlrP05531 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
XlrP05531 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
XlrP05531 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
XlrP05531 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
XlrP05531 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
XlrP05531 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
XlrP05531 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
XlrP05531 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
XlrP05531 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
XlrP05531 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
XlrP05531 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
XlrP05531 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
XlrP05531 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
XlrP05531 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
XlrP05531 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
XlrP05531 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
XlrP05531 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
XlrP05531 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
XlrP05531 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
XlrP05531 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
XlrP05531 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
XlrP05531 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
XlrP05531 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
XlrP05531 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
XlrP05531 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
XlrP05531 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
XlrP05531 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms