Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tgfb1P04202 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tgfb1P04202 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tgfb1P04202 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tgfb1P04202 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tgfb1P04202 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tgfb1P04202 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tgfb1P04202 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tgfb1P04202 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tgfb1P04202 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tgfb1P04202 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tgfb1P04202 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tgfb1P04202 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tgfb1P04202 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tgfb1P04202 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tgfb1P04202 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tgfb1P04202 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tgfb1P04202 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tgfb1P04202 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tgfb1P04202 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tgfb1P04202 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tgfb1P04202 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tgfb1P04202 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tgfb1P04202 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tgfb1P04202 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tgfb1P04202 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tgfb1P04202 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgfb1P04202 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgfb1P04202 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgfb1P04202 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tgfb1P04202 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tgfb1P04202 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tgfb1P04202 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tgfb1P04202 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tgfb1P04202 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tgfb1P04202 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tgfb1P04202 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tgfb1P04202 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tgfb1P04202 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tgfb1P04202 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tgfb1P04202 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tgfb1P04202 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tgfb1P04202 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tgfb1P04202 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tgfb1P04202 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tgfb1P04202 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tgfb1P04202 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tgfb1P04202 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tgfb1P04202 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tgfb1P04202 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tgfb1P04202 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tgfb1P04202 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tgfb1P04202 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tgfb1P04202 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tgfb1P04202 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tgfb1P04202 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tgfb1P04202 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tgfb1P04202 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tgfb1P04202 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tgfb1P04202 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tgfb1P04202 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tgfb1P04202 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tgfb1P04202 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tgfb1P04202 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tgfb1P04202 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tgfb1P04202 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tgfb1P04202 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tgfb1P04202 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tgfb1P04202 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tgfb1P04202 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tgfb1P04202 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tgfb1P04202 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tgfb1P04202 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tgfb1P04202 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tgfb1P04202 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tgfb1P04202 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tgfb1P04202 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tgfb1P04202 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tgfb1P04202 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tgfb1P04202 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tgfb1P04202 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tgfb1P04202 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tgfb1P04202 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tgfb1P04202 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tgfb1P04202 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tgfb1P04202 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tgfb1P04202 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tgfb1P04202 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tgfb1P04202 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tgfb1P04202 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tgfb1P04202 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tgfb1P04202 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tgfb1P04202 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tgfb1P04202 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tgfb1P04202 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tgfb1P04202 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tgfb1P04202 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tgfb1P04202 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tgfb1P04202 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tgfb1P04202 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms