Protein–RNA interactions for Protein: P01729

Ig lambda-2 chain V region MOPC 315, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01729 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17,28■□□□□ 0,36
P01729 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17,28■□□□□ 0,36
P01729 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,28■□□□□ 0,36
P01729 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC17,27■□□□□ 0,36
P01729 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC17,27■□□□□ 0,36
P01729 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17,27■□□□□ 0,36
P01729 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,27■□□□□ 0,36
P01729 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC17,27■□□□□ 0,35
P01729 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,26■□□□□ 0,35
P01729 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,26■□□□□ 0,35
P01729 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,26■□□□□ 0,35
P01729 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17,26■□□□□ 0,35
P01729 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17,26■□□□□ 0,35
P01729 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,26■□□□□ 0,35
P01729 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,26■□□□□ 0,35
P01729 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17,25■□□□□ 0,35
P01729 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,24■□□□□ 0,35
P01729 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,24■□□□□ 0,35
P01729 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17,24■□□□□ 0,35
P01729 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,24■□□□□ 0,35
P01729 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17,24■□□□□ 0,35
P01729 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC17,24■□□□□ 0,35
P01729 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC17,23■□□□□ 0,35
P01729 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,23■□□□□ 0,35
P01729 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC17,23■□□□□ 0,35
P01729 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,23■□□□□ 0,35
P01729 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17,22■□□□□ 0,35
P01729 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,22■□□□□ 0,35
P01729 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17,22■□□□□ 0,35
P01729 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,22■□□□□ 0,35
P01729 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,21■□□□□ 0,35
P01729 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,21■□□□□ 0,35
P01729 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,21■□□□□ 0,35
P01729 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,2■□□□□ 0,34
P01729 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17,19■□□□□ 0,34
P01729 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17,19■□□□□ 0,34
P01729 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,19■□□□□ 0,34
P01729 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,19■□□□□ 0,34
P01729 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,18■□□□□ 0,34
P01729 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17,18■□□□□ 0,34
P01729 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17,18■□□□□ 0,34
P01729 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,18■□□□□ 0,34
P01729 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17,18■□□□□ 0,34
P01729 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17,17■□□□□ 0,34
P01729 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17,17■□□□□ 0,34
P01729 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,17■□□□□ 0,34
P01729 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,16■□□□□ 0,34
P01729 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,16■□□□□ 0,34
P01729 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC17,16■□□□□ 0,34
P01729 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17,16■□□□□ 0,34
P01729 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC17,16■□□□□ 0,34
P01729 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,15■□□□□ 0,34
P01729 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17,15■□□□□ 0,34
P01729 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,15■□□□□ 0,34
P01729 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,14■□□□□ 0,33
P01729 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC17,13■□□□□ 0,33
P01729 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,13■□□□□ 0,33
P01729 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,13■□□□□ 0,33
P01729 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,12■□□□□ 0,33
P01729 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17,11■□□□□ 0,33
P01729 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,11■□□□□ 0,33
P01729 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,11■□□□□ 0,33
P01729 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17,11■□□□□ 0,33
P01729 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC17,11■□□□□ 0,33
P01729 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17,1■□□□□ 0,33
P01729 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,1■□□□□ 0,33
P01729 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,09■□□□□ 0,33
P01729 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17,09■□□□□ 0,33
P01729 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17,09■□□□□ 0,33
P01729 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17,09■□□□□ 0,33
P01729 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,08■□□□□ 0,33
P01729 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17,08■□□□□ 0,32
P01729 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17,08■□□□□ 0,32
P01729 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17,08■□□□□ 0,32
P01729 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,08■□□□□ 0,32
P01729 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17,07■□□□□ 0,32
P01729 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17,06■□□□□ 0,32
P01729 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17,06■□□□□ 0,32
P01729 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,06■□□□□ 0,32
P01729 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,05■□□□□ 0,32
P01729 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,05■□□□□ 0,32
P01729 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,05■□□□□ 0,32
P01729 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,05■□□□□ 0,32
P01729 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17,05■□□□□ 0,32
P01729 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,05■□□□□ 0,32
P01729 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,04■□□□□ 0,32
P01729 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC17,04■□□□□ 0,32
P01729 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17,03■□□□□ 0,32
P01729 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,03■□□□□ 0,32
P01729 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,02■□□□□ 0,32
P01729 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,02■□□□□ 0,32
P01729 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,02■□□□□ 0,32
P01729 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,02■□□□□ 0,32
P01729 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17,02■□□□□ 0,32
P01729 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,02■□□□□ 0,32
P01729 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17,02■□□□□ 0,32
P01729 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,02■□□□□ 0,32
P01729 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17,02■□□□□ 0,32
P01729 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0,31
P01729 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0,31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27,1 ms