Protein–RNA interactions for Protein: P01657

Ig kappa chain V-III region PC 2413, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01657 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
P01657 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
P01657 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
P01657 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P01657 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
P01657 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
P01657 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
P01657 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
P01657 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
P01657 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
P01657 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
P01657 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
P01657 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
P01657 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
P01657 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
P01657 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
P01657 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
P01657 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
P01657 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
P01657 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
P01657 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
P01657 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
P01657 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
P01657 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
P01657 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
P01657 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
P01657 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
P01657 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
P01657 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
P01657 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
P01657 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
P01657 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
P01657 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
P01657 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
P01657 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
P01657 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
P01657 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
P01657 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
P01657 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
P01657 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
P01657 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
P01657 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
P01657 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
P01657 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
P01657 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
P01657 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
P01657 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
P01657 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
P01657 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
P01657 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
P01657 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
P01657 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
P01657 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P01657 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
P01657 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
P01657 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
P01657 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
P01657 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
P01657 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
P01657 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
P01657 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P01657 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
P01657 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
P01657 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
P01657 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
P01657 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
P01657 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
P01657 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
P01657 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
P01657 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
P01657 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
P01657 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
P01657 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P01657 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
P01657 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P01657 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P01657 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
P01657 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P01657 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
P01657 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
P01657 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
P01657 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
P01657 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
P01657 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
P01657 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
P01657 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P01657 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P01657 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
P01657 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
P01657 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
P01657 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
P01657 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P01657 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P01657 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P01657 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
P01657 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P01657 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P01657 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
P01657 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
P01657 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms