Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccl20O89093 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccl20O89093 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccl20O89093 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccl20O89093 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccl20O89093 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccl20O89093 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccl20O89093 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccl20O89093 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccl20O89093 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccl20O89093 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccl20O89093 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccl20O89093 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccl20O89093 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccl20O89093 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccl20O89093 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccl20O89093 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccl20O89093 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccl20O89093 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccl20O89093 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccl20O89093 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccl20O89093 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccl20O89093 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccl20O89093 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccl20O89093 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccl20O89093 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccl20O89093 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccl20O89093 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccl20O89093 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccl20O89093 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccl20O89093 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccl20O89093 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccl20O89093 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccl20O89093 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccl20O89093 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccl20O89093 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccl20O89093 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccl20O89093 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccl20O89093 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccl20O89093 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccl20O89093 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccl20O89093 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccl20O89093 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccl20O89093 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccl20O89093 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccl20O89093 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccl20O89093 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccl20O89093 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccl20O89093 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccl20O89093 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccl20O89093 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccl20O89093 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccl20O89093 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccl20O89093 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccl20O89093 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccl20O89093 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccl20O89093 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccl20O89093 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccl20O89093 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccl20O89093 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccl20O89093 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccl20O89093 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccl20O89093 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccl20O89093 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccl20O89093 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccl20O89093 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccl20O89093 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccl20O89093 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccl20O89093 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccl20O89093 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccl20O89093 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccl20O89093 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccl20O89093 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccl20O89093 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccl20O89093 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccl20O89093 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccl20O89093 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccl20O89093 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccl20O89093 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccl20O89093 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccl20O89093 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccl20O89093 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccl20O89093 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccl20O89093 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccl20O89093 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccl20O89093 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccl20O89093 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccl20O89093 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccl20O89093 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccl20O89093 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccl20O89093 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccl20O89093 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccl20O89093 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccl20O89093 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccl20O89093 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccl20O89093 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccl20O89093 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccl20O89093 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccl20O89093 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccl20O89093 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
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