Protein–RNA interactions for Protein: O89026

Robo1, Roundabout homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo1O89026 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Robo1O89026 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Robo1O89026 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Robo1O89026 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Robo1O89026 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Robo1O89026 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Robo1O89026 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Robo1O89026 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Robo1O89026 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Robo1O89026 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Robo1O89026 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Robo1O89026 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Robo1O89026 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Robo1O89026 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Robo1O89026 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Robo1O89026 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Robo1O89026 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Robo1O89026 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Robo1O89026 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Robo1O89026 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Robo1O89026 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Robo1O89026 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Robo1O89026 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Robo1O89026 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Robo1O89026 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Robo1O89026 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Robo1O89026 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Robo1O89026 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Robo1O89026 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Robo1O89026 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Robo1O89026 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Robo1O89026 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Robo1O89026 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Robo1O89026 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Robo1O89026 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Robo1O89026 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Robo1O89026 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Robo1O89026 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Robo1O89026 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Robo1O89026 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Robo1O89026 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Robo1O89026 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Robo1O89026 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Robo1O89026 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Robo1O89026 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Robo1O89026 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Robo1O89026 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Robo1O89026 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Robo1O89026 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Robo1O89026 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Robo1O89026 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Robo1O89026 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Robo1O89026 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Robo1O89026 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Robo1O89026 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Robo1O89026 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Robo1O89026 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Robo1O89026 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Robo1O89026 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Robo1O89026 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Robo1O89026 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Robo1O89026 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Robo1O89026 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Robo1O89026 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Robo1O89026 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Robo1O89026 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Robo1O89026 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Robo1O89026 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Robo1O89026 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Robo1O89026 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Robo1O89026 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Robo1O89026 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Robo1O89026 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Robo1O89026 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Robo1O89026 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Robo1O89026 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Robo1O89026 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Robo1O89026 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
Robo1O89026 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Robo1O89026 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Robo1O89026 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Robo1O89026 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Robo1O89026 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Robo1O89026 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Robo1O89026 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Robo1O89026 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Robo1O89026 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Robo1O89026 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Robo1O89026 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Robo1O89026 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Robo1O89026 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Robo1O89026 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Robo1O89026 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Robo1O89026 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Robo1O89026 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Robo1O89026 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Robo1O89026 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Robo1O89026 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Robo1O89026 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Robo1O89026 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms