Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dnmt3aO88508 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnmt3aO88508 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dnmt3aO88508 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Dnmt3aO88508 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dnmt3aO88508 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dnmt3aO88508 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnmt3aO88508 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnmt3aO88508 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnmt3aO88508 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dnmt3aO88508 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Dnmt3aO88508 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dnmt3aO88508 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dnmt3aO88508 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dnmt3aO88508 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dnmt3aO88508 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dnmt3aO88508 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Dnmt3aO88508 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnmt3aO88508 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dnmt3aO88508 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dnmt3aO88508 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dnmt3aO88508 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dnmt3aO88508 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dnmt3aO88508 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dnmt3aO88508 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dnmt3aO88508 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dnmt3aO88508 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dnmt3aO88508 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dnmt3aO88508 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dnmt3aO88508 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dnmt3aO88508 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dnmt3aO88508 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dnmt3aO88508 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dnmt3aO88508 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dnmt3aO88508 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dnmt3aO88508 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dnmt3aO88508 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dnmt3aO88508 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Dnmt3aO88508 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dnmt3aO88508 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dnmt3aO88508 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dnmt3aO88508 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dnmt3aO88508 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dnmt3aO88508 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dnmt3aO88508 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dnmt3aO88508 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dnmt3aO88508 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dnmt3aO88508 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dnmt3aO88508 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dnmt3aO88508 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dnmt3aO88508 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dnmt3aO88508 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dnmt3aO88508 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dnmt3aO88508 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dnmt3aO88508 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dnmt3aO88508 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dnmt3aO88508 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dnmt3aO88508 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dnmt3aO88508 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dnmt3aO88508 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dnmt3aO88508 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dnmt3aO88508 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dnmt3aO88508 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dnmt3aO88508 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dnmt3aO88508 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dnmt3aO88508 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dnmt3aO88508 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dnmt3aO88508 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dnmt3aO88508 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dnmt3aO88508 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dnmt3aO88508 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dnmt3aO88508 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dnmt3aO88508 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dnmt3aO88508 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dnmt3aO88508 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dnmt3aO88508 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dnmt3aO88508 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dnmt3aO88508 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Dnmt3aO88508 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dnmt3aO88508 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dnmt3aO88508 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dnmt3aO88508 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dnmt3aO88508 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dnmt3aO88508 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Dnmt3aO88508 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dnmt3aO88508 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dnmt3aO88508 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dnmt3aO88508 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dnmt3aO88508 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dnmt3aO88508 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dnmt3aO88508 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dnmt3aO88508 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dnmt3aO88508 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Dnmt3aO88508 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dnmt3aO88508 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dnmt3aO88508 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dnmt3aO88508 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dnmt3aO88508 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dnmt3aO88508 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Dnmt3aO88508 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms