Protein–RNA interactions for Protein: O70343

Ppargc1a, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1aO70343 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppargc1aO70343 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppargc1aO70343 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppargc1aO70343 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppargc1aO70343 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppargc1aO70343 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppargc1aO70343 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppargc1aO70343 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppargc1aO70343 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppargc1aO70343 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppargc1aO70343 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppargc1aO70343 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppargc1aO70343 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppargc1aO70343 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ppargc1aO70343 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppargc1aO70343 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppargc1aO70343 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppargc1aO70343 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppargc1aO70343 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppargc1aO70343 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppargc1aO70343 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppargc1aO70343 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppargc1aO70343 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppargc1aO70343 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppargc1aO70343 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppargc1aO70343 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppargc1aO70343 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppargc1aO70343 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppargc1aO70343 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppargc1aO70343 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppargc1aO70343 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppargc1aO70343 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppargc1aO70343 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppargc1aO70343 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppargc1aO70343 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppargc1aO70343 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppargc1aO70343 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppargc1aO70343 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppargc1aO70343 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppargc1aO70343 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppargc1aO70343 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppargc1aO70343 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppargc1aO70343 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppargc1aO70343 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppargc1aO70343 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppargc1aO70343 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppargc1aO70343 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppargc1aO70343 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppargc1aO70343 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppargc1aO70343 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppargc1aO70343 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppargc1aO70343 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppargc1aO70343 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppargc1aO70343 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppargc1aO70343 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppargc1aO70343 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppargc1aO70343 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppargc1aO70343 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppargc1aO70343 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppargc1aO70343 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppargc1aO70343 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppargc1aO70343 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppargc1aO70343 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppargc1aO70343 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppargc1aO70343 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppargc1aO70343 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppargc1aO70343 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppargc1aO70343 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppargc1aO70343 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppargc1aO70343 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppargc1aO70343 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppargc1aO70343 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppargc1aO70343 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppargc1aO70343 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ppargc1aO70343 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ppargc1aO70343 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppargc1aO70343 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppargc1aO70343 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppargc1aO70343 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppargc1aO70343 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppargc1aO70343 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppargc1aO70343 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppargc1aO70343 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppargc1aO70343 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppargc1aO70343 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppargc1aO70343 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppargc1aO70343 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ppargc1aO70343 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ppargc1aO70343 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppargc1aO70343 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppargc1aO70343 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppargc1aO70343 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppargc1aO70343 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppargc1aO70343 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppargc1aO70343 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppargc1aO70343 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppargc1aO70343 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppargc1aO70343 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppargc1aO70343 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppargc1aO70343 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms