Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Lnx1O70263 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Lnx1O70263 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lnx1O70263 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lnx1O70263 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lnx1O70263 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lnx1O70263 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lnx1O70263 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lnx1O70263 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lnx1O70263 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lnx1O70263 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lnx1O70263 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lnx1O70263 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lnx1O70263 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lnx1O70263 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lnx1O70263 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lnx1O70263 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lnx1O70263 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Lnx1O70263 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lnx1O70263 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lnx1O70263 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lnx1O70263 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Lnx1O70263 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lnx1O70263 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lnx1O70263 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lnx1O70263 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Lnx1O70263 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Lnx1O70263 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Lnx1O70263 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Lnx1O70263 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lnx1O70263 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lnx1O70263 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lnx1O70263 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lnx1O70263 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lnx1O70263 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lnx1O70263 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lnx1O70263 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lnx1O70263 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lnx1O70263 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lnx1O70263 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lnx1O70263 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lnx1O70263 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lnx1O70263 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lnx1O70263 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Lnx1O70263 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lnx1O70263 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lnx1O70263 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lnx1O70263 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Lnx1O70263 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Lnx1O70263 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Lnx1O70263 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lnx1O70263 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lnx1O70263 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Lnx1O70263 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lnx1O70263 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Lnx1O70263 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lnx1O70263 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lnx1O70263 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lnx1O70263 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lnx1O70263 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lnx1O70263 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Lnx1O70263 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lnx1O70263 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lnx1O70263 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lnx1O70263 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Lnx1O70263 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lnx1O70263 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lnx1O70263 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lnx1O70263 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lnx1O70263 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lnx1O70263 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lnx1O70263 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lnx1O70263 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Lnx1O70263 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lnx1O70263 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lnx1O70263 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lnx1O70263 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lnx1O70263 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lnx1O70263 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lnx1O70263 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lnx1O70263 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lnx1O70263 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
Lnx1O70263 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lnx1O70263 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lnx1O70263 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Lnx1O70263 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Lnx1O70263 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lnx1O70263 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lnx1O70263 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lnx1O70263 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lnx1O70263 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lnx1O70263 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lnx1O70263 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Lnx1O70263 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lnx1O70263 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Lnx1O70263 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lnx1O70263 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lnx1O70263 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lnx1O70263 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lnx1O70263 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms