Protein–RNA interactions for Protein: O70230

Znf143, Zinc finger protein 143, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf143O70230 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Znf143O70230 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Znf143O70230 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf143O70230 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf143O70230 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf143O70230 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf143O70230 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf143O70230 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Znf143O70230 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Znf143O70230 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Znf143O70230 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Znf143O70230 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Znf143O70230 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Znf143O70230 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Znf143O70230 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Znf143O70230 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Znf143O70230 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf143O70230 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf143O70230 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf143O70230 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf143O70230 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf143O70230 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf143O70230 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Znf143O70230 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Znf143O70230 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Znf143O70230 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf143O70230 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf143O70230 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf143O70230 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znf143O70230 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znf143O70230 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znf143O70230 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znf143O70230 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf143O70230 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Znf143O70230 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Znf143O70230 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf143O70230 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf143O70230 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf143O70230 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf143O70230 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf143O70230 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf143O70230 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf143O70230 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf143O70230 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf143O70230 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf143O70230 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf143O70230 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf143O70230 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf143O70230 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf143O70230 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf143O70230 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf143O70230 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf143O70230 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf143O70230 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf143O70230 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf143O70230 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf143O70230 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf143O70230 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf143O70230 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf143O70230 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf143O70230 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf143O70230 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf143O70230 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf143O70230 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf143O70230 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf143O70230 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Znf143O70230 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf143O70230 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf143O70230 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf143O70230 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf143O70230 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf143O70230 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf143O70230 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf143O70230 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf143O70230 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf143O70230 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf143O70230 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf143O70230 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf143O70230 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf143O70230 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Znf143O70230 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Znf143O70230 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Znf143O70230 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf143O70230 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf143O70230 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf143O70230 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf143O70230 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf143O70230 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf143O70230 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf143O70230 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf143O70230 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf143O70230 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf143O70230 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf143O70230 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf143O70230 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf143O70230 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf143O70230 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Znf143O70230 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Znf143O70230 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Znf143O70230 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.3 ms