Protein–RNA interactions for Protein: O70157

Top3a, DNA topoisomerase 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3aO70157 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Top3aO70157 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Top3aO70157 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Top3aO70157 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Top3aO70157 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Top3aO70157 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Top3aO70157 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Top3aO70157 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Top3aO70157 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Top3aO70157 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Top3aO70157 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Top3aO70157 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Top3aO70157 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Top3aO70157 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Top3aO70157 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Top3aO70157 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Top3aO70157 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Top3aO70157 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Top3aO70157 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Top3aO70157 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Top3aO70157 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Top3aO70157 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Top3aO70157 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Top3aO70157 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Top3aO70157 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Top3aO70157 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Top3aO70157 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Top3aO70157 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Top3aO70157 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Top3aO70157 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Top3aO70157 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Top3aO70157 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Top3aO70157 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Top3aO70157 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Top3aO70157 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Top3aO70157 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Top3aO70157 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Top3aO70157 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Top3aO70157 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top3aO70157 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top3aO70157 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top3aO70157 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top3aO70157 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top3aO70157 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Top3aO70157 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Top3aO70157 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Top3aO70157 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Top3aO70157 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Top3aO70157 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Top3aO70157 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Top3aO70157 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Top3aO70157 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Top3aO70157 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Top3aO70157 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Top3aO70157 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Top3aO70157 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Top3aO70157 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Top3aO70157 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Top3aO70157 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Top3aO70157 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Top3aO70157 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Top3aO70157 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Top3aO70157 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Top3aO70157 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Top3aO70157 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Top3aO70157 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Top3aO70157 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Top3aO70157 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Top3aO70157 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Top3aO70157 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Top3aO70157 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Top3aO70157 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Top3aO70157 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Top3aO70157 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Top3aO70157 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Top3aO70157 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Top3aO70157 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Top3aO70157 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Top3aO70157 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Top3aO70157 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Top3aO70157 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Top3aO70157 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Top3aO70157 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Top3aO70157 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Top3aO70157 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Top3aO70157 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Top3aO70157 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Top3aO70157 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Top3aO70157 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Top3aO70157 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Top3aO70157 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Top3aO70157 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Top3aO70157 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Top3aO70157 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Top3aO70157 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Top3aO70157 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Top3aO70157 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Top3aO70157 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Top3aO70157 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Top3aO70157 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms