Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl35aO55142 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl35aO55142 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl35aO55142 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl35aO55142 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl35aO55142 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl35aO55142 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl35aO55142 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl35aO55142 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl35aO55142 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl35aO55142 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl35aO55142 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl35aO55142 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rpl35aO55142 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl35aO55142 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl35aO55142 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl35aO55142 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl35aO55142 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl35aO55142 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl35aO55142 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl35aO55142 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl35aO55142 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl35aO55142 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl35aO55142 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl35aO55142 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl35aO55142 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl35aO55142 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl35aO55142 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl35aO55142 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl35aO55142 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl35aO55142 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl35aO55142 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl35aO55142 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl35aO55142 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl35aO55142 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl35aO55142 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl35aO55142 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl35aO55142 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl35aO55142 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl35aO55142 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl35aO55142 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl35aO55142 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl35aO55142 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl35aO55142 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl35aO55142 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl35aO55142 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl35aO55142 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl35aO55142 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl35aO55142 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl35aO55142 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl35aO55142 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl35aO55142 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl35aO55142 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl35aO55142 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpl35aO55142 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl35aO55142 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl35aO55142 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl35aO55142 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl35aO55142 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl35aO55142 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl35aO55142 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl35aO55142 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl35aO55142 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl35aO55142 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl35aO55142 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl35aO55142 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl35aO55142 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl35aO55142 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl35aO55142 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl35aO55142 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl35aO55142 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl35aO55142 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl35aO55142 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl35aO55142 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl35aO55142 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl35aO55142 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl35aO55142 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl35aO55142 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl35aO55142 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl35aO55142 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl35aO55142 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpl35aO55142 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpl35aO55142 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl35aO55142 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl35aO55142 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl35aO55142 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl35aO55142 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl35aO55142 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl35aO55142 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl35aO55142 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl35aO55142 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl35aO55142 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl35aO55142 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl35aO55142 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl35aO55142 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl35aO55142 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl35aO55142 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl35aO55142 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl35aO55142 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl35aO55142 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms