Protein–RNA interactions for Protein: O55112

Aff2, AF4/FMR2 family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff2O55112 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Aff2O55112 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Aff2O55112 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Aff2O55112 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Aff2O55112 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Aff2O55112 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Aff2O55112 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Aff2O55112 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Aff2O55112 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Aff2O55112 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Aff2O55112 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Aff2O55112 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Aff2O55112 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Aff2O55112 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Aff2O55112 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Aff2O55112 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Aff2O55112 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Aff2O55112 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Aff2O55112 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Aff2O55112 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Aff2O55112 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Aff2O55112 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Aff2O55112 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Aff2O55112 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Aff2O55112 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Aff2O55112 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Aff2O55112 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Aff2O55112 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Aff2O55112 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Aff2O55112 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Aff2O55112 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Aff2O55112 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Aff2O55112 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Aff2O55112 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Aff2O55112 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Aff2O55112 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Aff2O55112 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Aff2O55112 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Aff2O55112 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Aff2O55112 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aff2O55112 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aff2O55112 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aff2O55112 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aff2O55112 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Aff2O55112 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Aff2O55112 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Aff2O55112 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Aff2O55112 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Aff2O55112 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aff2O55112 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aff2O55112 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aff2O55112 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Aff2O55112 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Aff2O55112 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Aff2O55112 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Aff2O55112 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Aff2O55112 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Aff2O55112 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Aff2O55112 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Aff2O55112 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Aff2O55112 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Aff2O55112 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Aff2O55112 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Aff2O55112 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Aff2O55112 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Aff2O55112 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Aff2O55112 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Aff2O55112 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Aff2O55112 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Aff2O55112 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Aff2O55112 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Aff2O55112 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Aff2O55112 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Aff2O55112 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Aff2O55112 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Aff2O55112 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Aff2O55112 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Aff2O55112 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Aff2O55112 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Aff2O55112 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Aff2O55112 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Aff2O55112 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Aff2O55112 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Aff2O55112 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Aff2O55112 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Aff2O55112 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Aff2O55112 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Aff2O55112 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Aff2O55112 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Aff2O55112 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Aff2O55112 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Aff2O55112 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Aff2O55112 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Aff2O55112 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Aff2O55112 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Aff2O55112 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Aff2O55112 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Aff2O55112 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Aff2O55112 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Aff2O55112 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms