Protein–RNA interactions for Protein: O55017

Cacna1b, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, mousemouse

Predictions only

Length 2,327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1bO55017 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cacna1bO55017 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacna1bO55017 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cacna1bO55017 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cacna1bO55017 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacna1bO55017 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacna1bO55017 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacna1bO55017 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Cacna1bO55017 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cacna1bO55017 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cacna1bO55017 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cacna1bO55017 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Cacna1bO55017 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cacna1bO55017 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cacna1bO55017 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Cacna1bO55017 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cacna1bO55017 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cacna1bO55017 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacna1bO55017 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cacna1bO55017 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacna1bO55017 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacna1bO55017 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacna1bO55017 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacna1bO55017 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacna1bO55017 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cacna1bO55017 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacna1bO55017 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacna1bO55017 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacna1bO55017 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cacna1bO55017 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cacna1bO55017 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cacna1bO55017 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cacna1bO55017 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cacna1bO55017 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacna1bO55017 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacna1bO55017 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cacna1bO55017 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cacna1bO55017 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacna1bO55017 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cacna1bO55017 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cacna1bO55017 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cacna1bO55017 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cacna1bO55017 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacna1bO55017 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cacna1bO55017 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cacna1bO55017 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cacna1bO55017 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cacna1bO55017 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cacna1bO55017 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cacna1bO55017 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cacna1bO55017 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cacna1bO55017 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cacna1bO55017 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cacna1bO55017 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cacna1bO55017 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacna1bO55017 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacna1bO55017 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cacna1bO55017 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cacna1bO55017 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cacna1bO55017 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cacna1bO55017 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cacna1bO55017 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cacna1bO55017 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cacna1bO55017 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cacna1bO55017 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cacna1bO55017 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cacna1bO55017 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cacna1bO55017 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cacna1bO55017 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cacna1bO55017 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cacna1bO55017 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cacna1bO55017 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cacna1bO55017 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cacna1bO55017 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cacna1bO55017 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cacna1bO55017 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacna1bO55017 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacna1bO55017 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacna1bO55017 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacna1bO55017 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacna1bO55017 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacna1bO55017 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacna1bO55017 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacna1bO55017 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacna1bO55017 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cacna1bO55017 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cacna1bO55017 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cacna1bO55017 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cacna1bO55017 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cacna1bO55017 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cacna1bO55017 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cacna1bO55017 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cacna1bO55017 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cacna1bO55017 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cacna1bO55017 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cacna1bO55017 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cacna1bO55017 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cacna1bO55017 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cacna1bO55017 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cacna1bO55017 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms