Protein–RNA interactions for Protein: O35668

Hap1, Huntingtin-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hap1O35668 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Hap1O35668 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Hap1O35668 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Hap1O35668 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Hap1O35668 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Hap1O35668 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Hap1O35668 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Hap1O35668 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Hap1O35668 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Hap1O35668 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Hap1O35668 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Hap1O35668 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Hap1O35668 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Hap1O35668 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Hap1O35668 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Hap1O35668 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Hap1O35668 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Hap1O35668 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Hap1O35668 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Hap1O35668 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Hap1O35668 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Hap1O35668 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Hap1O35668 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Hap1O35668 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Hap1O35668 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Hap1O35668 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Hap1O35668 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Hap1O35668 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Hap1O35668 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Hap1O35668 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Hap1O35668 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Hap1O35668 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Hap1O35668 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Hap1O35668 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Hap1O35668 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Hap1O35668 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Hap1O35668 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Hap1O35668 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Hap1O35668 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Hap1O35668 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Hap1O35668 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Hap1O35668 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Hap1O35668 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Hap1O35668 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Hap1O35668 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Hap1O35668 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Hap1O35668 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Hap1O35668 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Hap1O35668 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Hap1O35668 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Hap1O35668 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Hap1O35668 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Hap1O35668 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Hap1O35668 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Hap1O35668 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Hap1O35668 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Hap1O35668 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Hap1O35668 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Hap1O35668 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Hap1O35668 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Hap1O35668 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Hap1O35668 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Hap1O35668 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Hap1O35668 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Hap1O35668 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Hap1O35668 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Hap1O35668 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Hap1O35668 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Hap1O35668 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Hap1O35668 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Hap1O35668 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Hap1O35668 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Hap1O35668 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Hap1O35668 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Hap1O35668 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Hap1O35668 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Hap1O35668 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Hap1O35668 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Hap1O35668 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Hap1O35668 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Hap1O35668 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Hap1O35668 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Hap1O35668 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Hap1O35668 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Hap1O35668 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Hap1O35668 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hap1O35668 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hap1O35668 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hap1O35668 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hap1O35668 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hap1O35668 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Hap1O35668 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Hap1O35668 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Hap1O35668 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Hap1O35668 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Hap1O35668 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hap1O35668 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hap1O35668 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hap1O35668 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Hap1O35668 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms