Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lhx8O35652 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lhx8O35652 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lhx8O35652 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lhx8O35652 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lhx8O35652 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lhx8O35652 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lhx8O35652 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lhx8O35652 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lhx8O35652 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lhx8O35652 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lhx8O35652 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lhx8O35652 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lhx8O35652 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lhx8O35652 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lhx8O35652 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lhx8O35652 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lhx8O35652 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lhx8O35652 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lhx8O35652 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lhx8O35652 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lhx8O35652 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lhx8O35652 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Lhx8O35652 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lhx8O35652 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lhx8O35652 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lhx8O35652 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lhx8O35652 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lhx8O35652 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Lhx8O35652 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lhx8O35652 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Lhx8O35652 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lhx8O35652 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lhx8O35652 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lhx8O35652 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Lhx8O35652 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lhx8O35652 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lhx8O35652 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lhx8O35652 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lhx8O35652 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lhx8O35652 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lhx8O35652 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lhx8O35652 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lhx8O35652 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Lhx8O35652 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lhx8O35652 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lhx8O35652 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lhx8O35652 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lhx8O35652 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lhx8O35652 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lhx8O35652 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lhx8O35652 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lhx8O35652 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lhx8O35652 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lhx8O35652 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lhx8O35652 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lhx8O35652 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lhx8O35652 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lhx8O35652 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lhx8O35652 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lhx8O35652 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lhx8O35652 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lhx8O35652 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Lhx8O35652 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lhx8O35652 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lhx8O35652 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lhx8O35652 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lhx8O35652 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lhx8O35652 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lhx8O35652 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lhx8O35652 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lhx8O35652 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lhx8O35652 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lhx8O35652 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lhx8O35652 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Lhx8O35652 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lhx8O35652 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lhx8O35652 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lhx8O35652 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lhx8O35652 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lhx8O35652 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lhx8O35652 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lhx8O35652 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lhx8O35652 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lhx8O35652 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lhx8O35652 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lhx8O35652 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lhx8O35652 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lhx8O35652 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lhx8O35652 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lhx8O35652 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lhx8O35652 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lhx8O35652 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lhx8O35652 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lhx8O35652 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lhx8O35652 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lhx8O35652 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lhx8O35652 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lhx8O35652 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lhx8O35652 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms