Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema6aO35464 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema6aO35464 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema6aO35464 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema6aO35464 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema6aO35464 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema6aO35464 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema6aO35464 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sema6aO35464 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sema6aO35464 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sema6aO35464 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema6aO35464 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema6aO35464 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema6aO35464 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema6aO35464 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema6aO35464 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema6aO35464 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema6aO35464 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema6aO35464 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema6aO35464 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema6aO35464 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema6aO35464 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sema6aO35464 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sema6aO35464 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sema6aO35464 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema6aO35464 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema6aO35464 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema6aO35464 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema6aO35464 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema6aO35464 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema6aO35464 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema6aO35464 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema6aO35464 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema6aO35464 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema6aO35464 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema6aO35464 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sema6aO35464 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sema6aO35464 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sema6aO35464 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sema6aO35464 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sema6aO35464 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sema6aO35464 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema6aO35464 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema6aO35464 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema6aO35464 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema6aO35464 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema6aO35464 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema6aO35464 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema6aO35464 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema6aO35464 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema6aO35464 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema6aO35464 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema6aO35464 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema6aO35464 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema6aO35464 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema6aO35464 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema6aO35464 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema6aO35464 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema6aO35464 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema6aO35464 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema6aO35464 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema6aO35464 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema6aO35464 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema6aO35464 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema6aO35464 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema6aO35464 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema6aO35464 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema6aO35464 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema6aO35464 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema6aO35464 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema6aO35464 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema6aO35464 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sema6aO35464 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema6aO35464 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema6aO35464 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema6aO35464 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema6aO35464 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema6aO35464 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema6aO35464 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema6aO35464 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema6aO35464 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema6aO35464 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema6aO35464 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema6aO35464 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema6aO35464 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema6aO35464 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema6aO35464 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema6aO35464 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema6aO35464 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema6aO35464 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sema6aO35464 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sema6aO35464 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sema6aO35464 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sema6aO35464 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema6aO35464 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema6aO35464 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sema6aO35464 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sema6aO35464 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sema6aO35464 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sema6aO35464 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms