Protein–RNA interactions for Protein: O35308

Slc16a8, Monocarboxylate transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc16a8O35308 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc16a8O35308 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc16a8O35308 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc16a8O35308 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc16a8O35308 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc16a8O35308 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc16a8O35308 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc16a8O35308 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc16a8O35308 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc16a8O35308 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc16a8O35308 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc16a8O35308 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc16a8O35308 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc16a8O35308 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc16a8O35308 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc16a8O35308 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc16a8O35308 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc16a8O35308 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc16a8O35308 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc16a8O35308 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc16a8O35308 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc16a8O35308 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slc16a8O35308 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc16a8O35308 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc16a8O35308 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc16a8O35308 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc16a8O35308 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc16a8O35308 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc16a8O35308 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc16a8O35308 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc16a8O35308 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc16a8O35308 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc16a8O35308 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc16a8O35308 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc16a8O35308 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc16a8O35308 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc16a8O35308 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc16a8O35308 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc16a8O35308 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc16a8O35308 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc16a8O35308 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc16a8O35308 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc16a8O35308 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc16a8O35308 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc16a8O35308 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc16a8O35308 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Slc16a8O35308 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc16a8O35308 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc16a8O35308 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc16a8O35308 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc16a8O35308 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc16a8O35308 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc16a8O35308 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc16a8O35308 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc16a8O35308 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc16a8O35308 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc16a8O35308 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc16a8O35308 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc16a8O35308 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc16a8O35308 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc16a8O35308 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc16a8O35308 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc16a8O35308 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc16a8O35308 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc16a8O35308 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc16a8O35308 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc16a8O35308 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc16a8O35308 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc16a8O35308 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc16a8O35308 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc16a8O35308 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc16a8O35308 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc16a8O35308 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc16a8O35308 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc16a8O35308 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc16a8O35308 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc16a8O35308 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc16a8O35308 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc16a8O35308 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc16a8O35308 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc16a8O35308 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc16a8O35308 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc16a8O35308 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc16a8O35308 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc16a8O35308 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc16a8O35308 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc16a8O35308 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc16a8O35308 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc16a8O35308 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc16a8O35308 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc16a8O35308 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc16a8O35308 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc16a8O35308 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc16a8O35308 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc16a8O35308 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc16a8O35308 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc16a8O35308 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc16a8O35308 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc16a8O35308 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc16a8O35308 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.3 ms