Protein–RNA interactions for Protein: O35126

Atn1, Atrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atn1O35126 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atn1O35126 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atn1O35126 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atn1O35126 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Atn1O35126 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atn1O35126 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atn1O35126 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atn1O35126 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atn1O35126 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atn1O35126 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atn1O35126 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atn1O35126 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atn1O35126 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atn1O35126 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atn1O35126 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atn1O35126 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Atn1O35126 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Atn1O35126 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atn1O35126 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atn1O35126 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atn1O35126 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atn1O35126 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atn1O35126 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atn1O35126 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atn1O35126 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atn1O35126 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atn1O35126 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atn1O35126 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atn1O35126 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atn1O35126 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atn1O35126 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atn1O35126 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Atn1O35126 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atn1O35126 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atn1O35126 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atn1O35126 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atn1O35126 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atn1O35126 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atn1O35126 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atn1O35126 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atn1O35126 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atn1O35126 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atn1O35126 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atn1O35126 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atn1O35126 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atn1O35126 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atn1O35126 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atn1O35126 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atn1O35126 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atn1O35126 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atn1O35126 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atn1O35126 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atn1O35126 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atn1O35126 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atn1O35126 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atn1O35126 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atn1O35126 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atn1O35126 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atn1O35126 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atn1O35126 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atn1O35126 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atn1O35126 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atn1O35126 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atn1O35126 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atn1O35126 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atn1O35126 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atn1O35126 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atn1O35126 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atn1O35126 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atn1O35126 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atn1O35126 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atn1O35126 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atn1O35126 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atn1O35126 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atn1O35126 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atn1O35126 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atn1O35126 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atn1O35126 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atn1O35126 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atn1O35126 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atn1O35126 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atn1O35126 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atn1O35126 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atn1O35126 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Atn1O35126 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atn1O35126 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atn1O35126 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atn1O35126 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atn1O35126 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atn1O35126 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atn1O35126 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atn1O35126 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atn1O35126 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atn1O35126 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atn1O35126 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atn1O35126 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atn1O35126 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atn1O35126 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atn1O35126 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atn1O35126 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms