Protein–RNA interactions for Protein: O09126

Sema4d, Semaphorin-4D, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4dO09126 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sema4dO09126 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sema4dO09126 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sema4dO09126 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sema4dO09126 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sema4dO09126 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sema4dO09126 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sema4dO09126 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sema4dO09126 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Sema4dO09126 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sema4dO09126 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sema4dO09126 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sema4dO09126 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sema4dO09126 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sema4dO09126 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sema4dO09126 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sema4dO09126 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sema4dO09126 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sema4dO09126 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sema4dO09126 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sema4dO09126 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sema4dO09126 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sema4dO09126 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sema4dO09126 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sema4dO09126 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sema4dO09126 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sema4dO09126 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sema4dO09126 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sema4dO09126 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sema4dO09126 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sema4dO09126 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sema4dO09126 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sema4dO09126 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Sema4dO09126 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sema4dO09126 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sema4dO09126 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sema4dO09126 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sema4dO09126 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sema4dO09126 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sema4dO09126 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sema4dO09126 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sema4dO09126 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sema4dO09126 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sema4dO09126 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sema4dO09126 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sema4dO09126 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sema4dO09126 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sema4dO09126 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sema4dO09126 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sema4dO09126 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sema4dO09126 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sema4dO09126 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Sema4dO09126 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sema4dO09126 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sema4dO09126 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sema4dO09126 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sema4dO09126 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sema4dO09126 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sema4dO09126 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Sema4dO09126 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sema4dO09126 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sema4dO09126 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sema4dO09126 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sema4dO09126 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sema4dO09126 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sema4dO09126 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sema4dO09126 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Sema4dO09126 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sema4dO09126 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sema4dO09126 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sema4dO09126 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sema4dO09126 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sema4dO09126 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sema4dO09126 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sema4dO09126 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sema4dO09126 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sema4dO09126 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sema4dO09126 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sema4dO09126 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sema4dO09126 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sema4dO09126 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sema4dO09126 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sema4dO09126 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sema4dO09126 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sema4dO09126 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sema4dO09126 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sema4dO09126 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sema4dO09126 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sema4dO09126 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sema4dO09126 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sema4dO09126 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sema4dO09126 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sema4dO09126 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sema4dO09126 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sema4dO09126 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sema4dO09126 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sema4dO09126 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sema4dO09126 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sema4dO09126 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sema4dO09126 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms