Protein–RNA interactions for Protein: J3QP72

Gm21738, Predicted gene, 21738, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21738J3QP72 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm21738J3QP72 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm21738J3QP72 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm21738J3QP72 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm21738J3QP72 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm21738J3QP72 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm21738J3QP72 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm21738J3QP72 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm21738J3QP72 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm21738J3QP72 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm21738J3QP72 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm21738J3QP72 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm21738J3QP72 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm21738J3QP72 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm21738J3QP72 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm21738J3QP72 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm21738J3QP72 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm21738J3QP72 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm21738J3QP72 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm21738J3QP72 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm21738J3QP72 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm21738J3QP72 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm21738J3QP72 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm21738J3QP72 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm21738J3QP72 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm21738J3QP72 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm21738J3QP72 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm21738J3QP72 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm21738J3QP72 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm21738J3QP72 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm21738J3QP72 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm21738J3QP72 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm21738J3QP72 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm21738J3QP72 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm21738J3QP72 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm21738J3QP72 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm21738J3QP72 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm21738J3QP72 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm21738J3QP72 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm21738J3QP72 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm21738J3QP72 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm21738J3QP72 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm21738J3QP72 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm21738J3QP72 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm21738J3QP72 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm21738J3QP72 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm21738J3QP72 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm21738J3QP72 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm21738J3QP72 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm21738J3QP72 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm21738J3QP72 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm21738J3QP72 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm21738J3QP72 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm21738J3QP72 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm21738J3QP72 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm21738J3QP72 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm21738J3QP72 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm21738J3QP72 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm21738J3QP72 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm21738J3QP72 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm21738J3QP72 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm21738J3QP72 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm21738J3QP72 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm21738J3QP72 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm21738J3QP72 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm21738J3QP72 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm21738J3QP72 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm21738J3QP72 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm21738J3QP72 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm21738J3QP72 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm21738J3QP72 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm21738J3QP72 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm21738J3QP72 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm21738J3QP72 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm21738J3QP72 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm21738J3QP72 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm21738J3QP72 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm21738J3QP72 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gm21738J3QP72 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm21738J3QP72 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm21738J3QP72 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm21738J3QP72 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm21738J3QP72 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm21738J3QP72 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm21738J3QP72 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm21738J3QP72 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm21738J3QP72 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm21738J3QP72 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm21738J3QP72 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm21738J3QP72 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm21738J3QP72 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm21738J3QP72 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm21738J3QP72 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm21738J3QP72 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm21738J3QP72 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm21738J3QP72 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm21738J3QP72 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm21738J3QP72 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm21738J3QP72 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm21738J3QP72 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms