Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA2

Gm28051, Predicted gene, 28051, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28051J3QMA2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm28051J3QMA2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm28051J3QMA2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm28051J3QMA2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm28051J3QMA2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm28051J3QMA2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm28051J3QMA2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm28051J3QMA2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm28051J3QMA2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm28051J3QMA2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm28051J3QMA2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm28051J3QMA2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm28051J3QMA2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm28051J3QMA2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm28051J3QMA2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm28051J3QMA2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm28051J3QMA2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm28051J3QMA2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm28051J3QMA2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm28051J3QMA2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm28051J3QMA2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm28051J3QMA2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm28051J3QMA2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm28051J3QMA2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm28051J3QMA2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm28051J3QMA2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm28051J3QMA2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm28051J3QMA2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm28051J3QMA2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm28051J3QMA2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm28051J3QMA2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm28051J3QMA2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm28051J3QMA2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm28051J3QMA2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm28051J3QMA2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28051J3QMA2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28051J3QMA2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28051J3QMA2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28051J3QMA2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28051J3QMA2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28051J3QMA2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28051J3QMA2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28051J3QMA2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28051J3QMA2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28051J3QMA2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28051J3QMA2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28051J3QMA2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm28051J3QMA2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm28051J3QMA2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm28051J3QMA2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm28051J3QMA2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm28051J3QMA2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm28051J3QMA2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm28051J3QMA2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm28051J3QMA2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm28051J3QMA2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm28051J3QMA2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm28051J3QMA2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm28051J3QMA2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm28051J3QMA2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm28051J3QMA2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm28051J3QMA2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm28051J3QMA2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm28051J3QMA2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm28051J3QMA2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm28051J3QMA2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm28051J3QMA2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm28051J3QMA2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm28051J3QMA2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm28051J3QMA2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm28051J3QMA2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm28051J3QMA2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm28051J3QMA2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm28051J3QMA2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm28051J3QMA2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm28051J3QMA2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm28051J3QMA2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm28051J3QMA2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm28051J3QMA2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm28051J3QMA2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm28051J3QMA2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm28051J3QMA2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm28051J3QMA2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm28051J3QMA2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm28051J3QMA2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm28051J3QMA2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm28051J3QMA2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm28051J3QMA2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm28051J3QMA2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm28051J3QMA2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm28051J3QMA2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm28051J3QMA2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm28051J3QMA2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm28051J3QMA2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm28051J3QMA2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm28051J3QMA2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm28051J3QMA2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm28051J3QMA2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm28051J3QMA2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm28051J3QMA2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms