Protein–RNA interactions for Protein: G5E897

Kdelc2, KDEL (Lys-Asp-Glu-Leu) containing 2, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdelc2G5E897 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kdelc2G5E897 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kdelc2G5E897 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kdelc2G5E897 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kdelc2G5E897 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kdelc2G5E897 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kdelc2G5E897 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kdelc2G5E897 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kdelc2G5E897 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kdelc2G5E897 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kdelc2G5E897 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kdelc2G5E897 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kdelc2G5E897 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kdelc2G5E897 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kdelc2G5E897 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Kdelc2G5E897 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Kdelc2G5E897 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Kdelc2G5E897 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Kdelc2G5E897 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Kdelc2G5E897 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Kdelc2G5E897 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Kdelc2G5E897 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Kdelc2G5E897 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Kdelc2G5E897 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Kdelc2G5E897 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Kdelc2G5E897 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Kdelc2G5E897 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Kdelc2G5E897 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Kdelc2G5E897 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Kdelc2G5E897 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Kdelc2G5E897 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Kdelc2G5E897 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Kdelc2G5E897 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Kdelc2G5E897 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Kdelc2G5E897 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Kdelc2G5E897 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Kdelc2G5E897 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kdelc2G5E897 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kdelc2G5E897 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Kdelc2G5E897 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Kdelc2G5E897 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Kdelc2G5E897 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Kdelc2G5E897 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kdelc2G5E897 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Kdelc2G5E897 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Kdelc2G5E897 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Kdelc2G5E897 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Kdelc2G5E897 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kdelc2G5E897 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kdelc2G5E897 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Kdelc2G5E897 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Kdelc2G5E897 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kdelc2G5E897 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kdelc2G5E897 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kdelc2G5E897 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kdelc2G5E897 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kdelc2G5E897 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kdelc2G5E897 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdelc2G5E897 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdelc2G5E897 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kdelc2G5E897 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kdelc2G5E897 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Kdelc2G5E897 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdelc2G5E897 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdelc2G5E897 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdelc2G5E897 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdelc2G5E897 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdelc2G5E897 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kdelc2G5E897 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Kdelc2G5E897 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kdelc2G5E897 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kdelc2G5E897 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kdelc2G5E897 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kdelc2G5E897 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kdelc2G5E897 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kdelc2G5E897 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kdelc2G5E897 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kdelc2G5E897 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kdelc2G5E897 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Kdelc2G5E897 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Kdelc2G5E897 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Kdelc2G5E897 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Kdelc2G5E897 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Kdelc2G5E897 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Kdelc2G5E897 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kdelc2G5E897 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kdelc2G5E897 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kdelc2G5E897 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kdelc2G5E897 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kdelc2G5E897 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kdelc2G5E897 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kdelc2G5E897 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Kdelc2G5E897 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Kdelc2G5E897 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Kdelc2G5E897 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Kdelc2G5E897 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Kdelc2G5E897 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Kdelc2G5E897 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Kdelc2G5E897 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Kdelc2G5E897 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms