Protein–RNA interactions for Protein: G3XA12

4933406M09Rik, RIKEN cDNA 4933406M09, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933406M09RikG3XA12 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
4933406M09RikG3XA12 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
4933406M09RikG3XA12 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
4933406M09RikG3XA12 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
4933406M09RikG3XA12 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
4933406M09RikG3XA12 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
4933406M09RikG3XA12 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
4933406M09RikG3XA12 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
4933406M09RikG3XA12 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
4933406M09RikG3XA12 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
4933406M09RikG3XA12 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
4933406M09RikG3XA12 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
4933406M09RikG3XA12 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
4933406M09RikG3XA12 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
4933406M09RikG3XA12 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
4933406M09RikG3XA12 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
4933406M09RikG3XA12 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
4933406M09RikG3XA12 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
4933406M09RikG3XA12 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
4933406M09RikG3XA12 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
4933406M09RikG3XA12 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
4933406M09RikG3XA12 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
4933406M09RikG3XA12 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
4933406M09RikG3XA12 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
4933406M09RikG3XA12 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
4933406M09RikG3XA12 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
4933406M09RikG3XA12 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
4933406M09RikG3XA12 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
4933406M09RikG3XA12 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
4933406M09RikG3XA12 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
4933406M09RikG3XA12 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
4933406M09RikG3XA12 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
4933406M09RikG3XA12 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
4933406M09RikG3XA12 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
4933406M09RikG3XA12 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
4933406M09RikG3XA12 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
4933406M09RikG3XA12 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
4933406M09RikG3XA12 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
4933406M09RikG3XA12 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
4933406M09RikG3XA12 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
4933406M09RikG3XA12 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
4933406M09RikG3XA12 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
4933406M09RikG3XA12 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
4933406M09RikG3XA12 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
4933406M09RikG3XA12 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
4933406M09RikG3XA12 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
4933406M09RikG3XA12 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
4933406M09RikG3XA12 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
4933406M09RikG3XA12 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
4933406M09RikG3XA12 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
4933406M09RikG3XA12 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
4933406M09RikG3XA12 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
4933406M09RikG3XA12 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
4933406M09RikG3XA12 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
4933406M09RikG3XA12 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
4933406M09RikG3XA12 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
4933406M09RikG3XA12 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
4933406M09RikG3XA12 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
4933406M09RikG3XA12 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
4933406M09RikG3XA12 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
4933406M09RikG3XA12 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
4933406M09RikG3XA12 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
4933406M09RikG3XA12 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
4933406M09RikG3XA12 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
4933406M09RikG3XA12 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
4933406M09RikG3XA12 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
4933406M09RikG3XA12 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
4933406M09RikG3XA12 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
4933406M09RikG3XA12 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
4933406M09RikG3XA12 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
4933406M09RikG3XA12 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
4933406M09RikG3XA12 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
4933406M09RikG3XA12 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
4933406M09RikG3XA12 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
4933406M09RikG3XA12 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
4933406M09RikG3XA12 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
4933406M09RikG3XA12 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
4933406M09RikG3XA12 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
4933406M09RikG3XA12 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
4933406M09RikG3XA12 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
4933406M09RikG3XA12 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
4933406M09RikG3XA12 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
4933406M09RikG3XA12 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
4933406M09RikG3XA12 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
4933406M09RikG3XA12 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
4933406M09RikG3XA12 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
4933406M09RikG3XA12 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
4933406M09RikG3XA12 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
4933406M09RikG3XA12 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
4933406M09RikG3XA12 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
4933406M09RikG3XA12 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
4933406M09RikG3XA12 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
4933406M09RikG3XA12 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
4933406M09RikG3XA12 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
4933406M09RikG3XA12 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
4933406M09RikG3XA12 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
4933406M09RikG3XA12 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
4933406M09RikG3XA12 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
4933406M09RikG3XA12 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
4933406M09RikG3XA12 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.8 ms