Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ3

Usp32, Ubiquitin-specific peptidase 32, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp32F8VPZ3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Usp32F8VPZ3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Usp32F8VPZ3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Usp32F8VPZ3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Usp32F8VPZ3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Usp32F8VPZ3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Usp32F8VPZ3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Usp32F8VPZ3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Usp32F8VPZ3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Usp32F8VPZ3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Usp32F8VPZ3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Usp32F8VPZ3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Usp32F8VPZ3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Usp32F8VPZ3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Usp32F8VPZ3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Usp32F8VPZ3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Usp32F8VPZ3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Usp32F8VPZ3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Usp32F8VPZ3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Usp32F8VPZ3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
Usp32F8VPZ3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Usp32F8VPZ3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Usp32F8VPZ3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Usp32F8VPZ3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
Usp32F8VPZ3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Usp32F8VPZ3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Usp32F8VPZ3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Usp32F8VPZ3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Usp32F8VPZ3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Usp32F8VPZ3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Usp32F8VPZ3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Usp32F8VPZ3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Usp32F8VPZ3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Usp32F8VPZ3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Usp32F8VPZ3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Usp32F8VPZ3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Usp32F8VPZ3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Usp32F8VPZ3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Usp32F8VPZ3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Usp32F8VPZ3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Usp32F8VPZ3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Usp32F8VPZ3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Usp32F8VPZ3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Usp32F8VPZ3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Usp32F8VPZ3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Usp32F8VPZ3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
Usp32F8VPZ3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Usp32F8VPZ3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Usp32F8VPZ3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Usp32F8VPZ3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Usp32F8VPZ3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Usp32F8VPZ3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Usp32F8VPZ3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Usp32F8VPZ3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
Usp32F8VPZ3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■■□ 3
Usp32F8VPZ3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Usp32F8VPZ3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Usp32F8VPZ3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Usp32F8VPZ3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Usp32F8VPZ3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Usp32F8VPZ3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Usp32F8VPZ3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Usp32F8VPZ3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Usp32F8VPZ3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Usp32F8VPZ3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Usp32F8VPZ3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
Usp32F8VPZ3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Usp32F8VPZ3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Usp32F8VPZ3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Usp32F8VPZ3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Usp32F8VPZ3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Usp32F8VPZ3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Usp32F8VPZ3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Usp32F8VPZ3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Usp32F8VPZ3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Usp32F8VPZ3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Usp32F8VPZ3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Usp32F8VPZ3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Usp32F8VPZ3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Usp32F8VPZ3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Usp32F8VPZ3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
Usp32F8VPZ3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Usp32F8VPZ3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Usp32F8VPZ3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Usp32F8VPZ3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Usp32F8VPZ3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Usp32F8VPZ3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Usp32F8VPZ3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Usp32F8VPZ3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Usp32F8VPZ3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Usp32F8VPZ3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Usp32F8VPZ3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Usp32F8VPZ3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Usp32F8VPZ3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Usp32F8VPZ3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Usp32F8VPZ3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Usp32F8VPZ3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Usp32F8VPZ3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Usp32F8VPZ3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Usp32F8VPZ3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms