Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
D430041D05RikF6ZGR6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
D430041D05RikF6ZGR6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
D430041D05RikF6ZGR6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
D430041D05RikF6ZGR6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
D430041D05RikF6ZGR6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
D430041D05RikF6ZGR6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.01■■■■□ 3.04
D430041D05RikF6ZGR6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
D430041D05RikF6ZGR6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
D430041D05RikF6ZGR6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
D430041D05RikF6ZGR6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
D430041D05RikF6ZGR6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
D430041D05RikF6ZGR6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
D430041D05RikF6ZGR6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
D430041D05RikF6ZGR6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
D430041D05RikF6ZGR6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
D430041D05RikF6ZGR6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
D430041D05RikF6ZGR6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
D430041D05RikF6ZGR6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
D430041D05RikF6ZGR6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
D430041D05RikF6ZGR6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
D430041D05RikF6ZGR6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
D430041D05RikF6ZGR6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
D430041D05RikF6ZGR6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
D430041D05RikF6ZGR6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
D430041D05RikF6ZGR6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
D430041D05RikF6ZGR6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
D430041D05RikF6ZGR6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
D430041D05RikF6ZGR6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
D430041D05RikF6ZGR6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
D430041D05RikF6ZGR6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
D430041D05RikF6ZGR6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
D430041D05RikF6ZGR6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
D430041D05RikF6ZGR6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC33.78■■■■□ 3
D430041D05RikF6ZGR6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
D430041D05RikF6ZGR6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
D430041D05RikF6ZGR6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
D430041D05RikF6ZGR6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
D430041D05RikF6ZGR6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
D430041D05RikF6ZGR6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
D430041D05RikF6ZGR6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
D430041D05RikF6ZGR6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
D430041D05RikF6ZGR6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
D430041D05RikF6ZGR6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
D430041D05RikF6ZGR6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
D430041D05RikF6ZGR6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
D430041D05RikF6ZGR6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
D430041D05RikF6ZGR6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
D430041D05RikF6ZGR6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
D430041D05RikF6ZGR6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
D430041D05RikF6ZGR6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
D430041D05RikF6ZGR6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
D430041D05RikF6ZGR6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
D430041D05RikF6ZGR6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
D430041D05RikF6ZGR6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
D430041D05RikF6ZGR6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
D430041D05RikF6ZGR6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
D430041D05RikF6ZGR6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
D430041D05RikF6ZGR6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
D430041D05RikF6ZGR6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
D430041D05RikF6ZGR6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
D430041D05RikF6ZGR6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
D430041D05RikF6ZGR6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
D430041D05RikF6ZGR6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
D430041D05RikF6ZGR6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
D430041D05RikF6ZGR6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
D430041D05RikF6ZGR6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
D430041D05RikF6ZGR6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
D430041D05RikF6ZGR6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
D430041D05RikF6ZGR6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
D430041D05RikF6ZGR6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
D430041D05RikF6ZGR6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
D430041D05RikF6ZGR6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
D430041D05RikF6ZGR6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
D430041D05RikF6ZGR6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
D430041D05RikF6ZGR6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
D430041D05RikF6ZGR6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
D430041D05RikF6ZGR6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
D430041D05RikF6ZGR6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
D430041D05RikF6ZGR6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
D430041D05RikF6ZGR6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
D430041D05RikF6ZGR6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
D430041D05RikF6ZGR6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
D430041D05RikF6ZGR6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
D430041D05RikF6ZGR6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
D430041D05RikF6ZGR6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
D430041D05RikF6ZGR6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
D430041D05RikF6ZGR6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC33.45■■■□□ 2.94
D430041D05RikF6ZGR6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
D430041D05RikF6ZGR6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
D430041D05RikF6ZGR6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
D430041D05RikF6ZGR6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
D430041D05RikF6ZGR6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
D430041D05RikF6ZGR6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
D430041D05RikF6ZGR6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
D430041D05RikF6ZGR6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
D430041D05RikF6ZGR6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
D430041D05RikF6ZGR6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
D430041D05RikF6ZGR6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms