Protein–RNA interactions for Protein: E9QAB6

Ptar1, Protein prenyltransferase alpha subunit repeat-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptar1E9QAB6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ptar1E9QAB6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ptar1E9QAB6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ptar1E9QAB6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ptar1E9QAB6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ptar1E9QAB6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ptar1E9QAB6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ptar1E9QAB6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ptar1E9QAB6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ptar1E9QAB6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ptar1E9QAB6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ptar1E9QAB6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ptar1E9QAB6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ptar1E9QAB6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ptar1E9QAB6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ptar1E9QAB6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ptar1E9QAB6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ptar1E9QAB6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ptar1E9QAB6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ptar1E9QAB6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ptar1E9QAB6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ptar1E9QAB6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ptar1E9QAB6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ptar1E9QAB6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ptar1E9QAB6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ptar1E9QAB6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ptar1E9QAB6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ptar1E9QAB6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ptar1E9QAB6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ptar1E9QAB6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ptar1E9QAB6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ptar1E9QAB6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ptar1E9QAB6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ptar1E9QAB6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ptar1E9QAB6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ptar1E9QAB6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ptar1E9QAB6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ptar1E9QAB6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ptar1E9QAB6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ptar1E9QAB6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ptar1E9QAB6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ptar1E9QAB6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ptar1E9QAB6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ptar1E9QAB6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ptar1E9QAB6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ptar1E9QAB6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ptar1E9QAB6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ptar1E9QAB6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ptar1E9QAB6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ptar1E9QAB6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ptar1E9QAB6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ptar1E9QAB6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ptar1E9QAB6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ptar1E9QAB6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ptar1E9QAB6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ptar1E9QAB6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptar1E9QAB6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptar1E9QAB6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ptar1E9QAB6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ptar1E9QAB6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ptar1E9QAB6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ptar1E9QAB6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ptar1E9QAB6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ptar1E9QAB6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ptar1E9QAB6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ptar1E9QAB6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ptar1E9QAB6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ptar1E9QAB6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ptar1E9QAB6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ptar1E9QAB6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ptar1E9QAB6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ptar1E9QAB6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ptar1E9QAB6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ptar1E9QAB6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ptar1E9QAB6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ptar1E9QAB6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ptar1E9QAB6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ptar1E9QAB6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ptar1E9QAB6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ptar1E9QAB6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ptar1E9QAB6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ptar1E9QAB6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ptar1E9QAB6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ptar1E9QAB6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ptar1E9QAB6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ptar1E9QAB6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ptar1E9QAB6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ptar1E9QAB6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ptar1E9QAB6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ptar1E9QAB6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ptar1E9QAB6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ptar1E9QAB6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ptar1E9QAB6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ptar1E9QAB6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ptar1E9QAB6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ptar1E9QAB6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ptar1E9QAB6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ptar1E9QAB6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ptar1E9QAB6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ptar1E9QAB6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms