Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q5

1700113H08Rik, RIKEN cDNA 1700113H08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700113H08RikE9Q9Q5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
1700113H08RikE9Q9Q5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
1700113H08RikE9Q9Q5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
1700113H08RikE9Q9Q5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
1700113H08RikE9Q9Q5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
1700113H08RikE9Q9Q5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
1700113H08RikE9Q9Q5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
1700113H08RikE9Q9Q5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
1700113H08RikE9Q9Q5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
1700113H08RikE9Q9Q5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
1700113H08RikE9Q9Q5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
1700113H08RikE9Q9Q5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
1700113H08RikE9Q9Q5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
1700113H08RikE9Q9Q5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
1700113H08RikE9Q9Q5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
1700113H08RikE9Q9Q5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
1700113H08RikE9Q9Q5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
1700113H08RikE9Q9Q5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
1700113H08RikE9Q9Q5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
1700113H08RikE9Q9Q5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
1700113H08RikE9Q9Q5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
1700113H08RikE9Q9Q5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
1700113H08RikE9Q9Q5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
1700113H08RikE9Q9Q5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
1700113H08RikE9Q9Q5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
1700113H08RikE9Q9Q5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
1700113H08RikE9Q9Q5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
1700113H08RikE9Q9Q5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
1700113H08RikE9Q9Q5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
1700113H08RikE9Q9Q5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
1700113H08RikE9Q9Q5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
1700113H08RikE9Q9Q5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
1700113H08RikE9Q9Q5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
1700113H08RikE9Q9Q5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
1700113H08RikE9Q9Q5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
1700113H08RikE9Q9Q5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
1700113H08RikE9Q9Q5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
1700113H08RikE9Q9Q5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
1700113H08RikE9Q9Q5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
1700113H08RikE9Q9Q5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
1700113H08RikE9Q9Q5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
1700113H08RikE9Q9Q5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
1700113H08RikE9Q9Q5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
1700113H08RikE9Q9Q5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
1700113H08RikE9Q9Q5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
1700113H08RikE9Q9Q5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
1700113H08RikE9Q9Q5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
1700113H08RikE9Q9Q5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
1700113H08RikE9Q9Q5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
1700113H08RikE9Q9Q5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
1700113H08RikE9Q9Q5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
1700113H08RikE9Q9Q5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
1700113H08RikE9Q9Q5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
1700113H08RikE9Q9Q5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
1700113H08RikE9Q9Q5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
1700113H08RikE9Q9Q5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
1700113H08RikE9Q9Q5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
1700113H08RikE9Q9Q5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
1700113H08RikE9Q9Q5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
1700113H08RikE9Q9Q5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
1700113H08RikE9Q9Q5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
1700113H08RikE9Q9Q5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
1700113H08RikE9Q9Q5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
1700113H08RikE9Q9Q5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
1700113H08RikE9Q9Q5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
1700113H08RikE9Q9Q5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
1700113H08RikE9Q9Q5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
1700113H08RikE9Q9Q5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
1700113H08RikE9Q9Q5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
1700113H08RikE9Q9Q5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
1700113H08RikE9Q9Q5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
1700113H08RikE9Q9Q5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
1700113H08RikE9Q9Q5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
1700113H08RikE9Q9Q5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
1700113H08RikE9Q9Q5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
1700113H08RikE9Q9Q5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
1700113H08RikE9Q9Q5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
1700113H08RikE9Q9Q5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
1700113H08RikE9Q9Q5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
1700113H08RikE9Q9Q5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
1700113H08RikE9Q9Q5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
1700113H08RikE9Q9Q5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
1700113H08RikE9Q9Q5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
1700113H08RikE9Q9Q5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
1700113H08RikE9Q9Q5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.6 ms