Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PtproE9Q612 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtproE9Q612 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtproE9Q612 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PtproE9Q612 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PtproE9Q612 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PtproE9Q612 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PtproE9Q612 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PtproE9Q612 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PtproE9Q612 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PtproE9Q612 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PtproE9Q612 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PtproE9Q612 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PtproE9Q612 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PtproE9Q612 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PtproE9Q612 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtproE9Q612 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PtproE9Q612 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtproE9Q612 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtproE9Q612 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PtproE9Q612 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PtproE9Q612 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PtproE9Q612 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PtproE9Q612 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PtproE9Q612 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PtproE9Q612 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PtproE9Q612 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PtproE9Q612 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PtproE9Q612 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PtproE9Q612 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PtproE9Q612 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PtproE9Q612 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PtproE9Q612 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PtproE9Q612 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PtproE9Q612 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PtproE9Q612 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PtproE9Q612 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PtproE9Q612 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PtproE9Q612 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PtproE9Q612 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PtproE9Q612 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PtproE9Q612 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtproE9Q612 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtproE9Q612 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PtproE9Q612 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PtproE9Q612 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PtproE9Q612 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PtproE9Q612 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PtproE9Q612 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PtproE9Q612 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PtproE9Q612 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PtproE9Q612 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PtproE9Q612 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PtproE9Q612 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PtproE9Q612 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PtproE9Q612 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtproE9Q612 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PtproE9Q612 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PtproE9Q612 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PtproE9Q612 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtproE9Q612 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtproE9Q612 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtproE9Q612 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtproE9Q612 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PtproE9Q612 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PtproE9Q612 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PtproE9Q612 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PtproE9Q612 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PtproE9Q612 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PtproE9Q612 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PtproE9Q612 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PtproE9Q612 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PtproE9Q612 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PtproE9Q612 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PtproE9Q612 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PtproE9Q612 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PtproE9Q612 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PtproE9Q612 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PtproE9Q612 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PtproE9Q612 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PtproE9Q612 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PtproE9Q612 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PtproE9Q612 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PtproE9Q612 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PtproE9Q612 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PtproE9Q612 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
PtproE9Q612 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PtproE9Q612 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PtproE9Q612 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PtproE9Q612 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PtproE9Q612 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PtproE9Q612 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PtproE9Q612 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PtproE9Q612 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PtproE9Q612 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtproE9Q612 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtproE9Q612 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PtproE9Q612 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PtproE9Q612 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PtproE9Q612 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms