Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5D8

Vmn2r48, Vomeronasal 2, receptor 48, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r48E9Q5D8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn2r48E9Q5D8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn2r48E9Q5D8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn2r48E9Q5D8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Vmn2r48E9Q5D8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn2r48E9Q5D8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn2r48E9Q5D8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn2r48E9Q5D8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn2r48E9Q5D8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn2r48E9Q5D8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn2r48E9Q5D8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn2r48E9Q5D8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn2r48E9Q5D8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn2r48E9Q5D8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn2r48E9Q5D8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn2r48E9Q5D8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn2r48E9Q5D8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn2r48E9Q5D8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn2r48E9Q5D8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn2r48E9Q5D8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn2r48E9Q5D8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn2r48E9Q5D8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn2r48E9Q5D8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn2r48E9Q5D8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn2r48E9Q5D8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn2r48E9Q5D8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn2r48E9Q5D8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn2r48E9Q5D8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn2r48E9Q5D8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn2r48E9Q5D8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn2r48E9Q5D8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn2r48E9Q5D8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn2r48E9Q5D8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn2r48E9Q5D8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn2r48E9Q5D8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn2r48E9Q5D8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn2r48E9Q5D8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn2r48E9Q5D8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn2r48E9Q5D8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn2r48E9Q5D8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn2r48E9Q5D8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn2r48E9Q5D8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn2r48E9Q5D8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn2r48E9Q5D8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn2r48E9Q5D8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn2r48E9Q5D8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn2r48E9Q5D8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn2r48E9Q5D8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vmn2r48E9Q5D8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vmn2r48E9Q5D8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn2r48E9Q5D8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn2r48E9Q5D8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn2r48E9Q5D8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn2r48E9Q5D8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn2r48E9Q5D8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn2r48E9Q5D8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn2r48E9Q5D8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn2r48E9Q5D8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn2r48E9Q5D8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn2r48E9Q5D8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn2r48E9Q5D8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn2r48E9Q5D8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn2r48E9Q5D8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn2r48E9Q5D8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn2r48E9Q5D8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn2r48E9Q5D8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn2r48E9Q5D8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn2r48E9Q5D8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn2r48E9Q5D8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn2r48E9Q5D8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn2r48E9Q5D8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmn2r48E9Q5D8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn2r48E9Q5D8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn2r48E9Q5D8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn2r48E9Q5D8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn2r48E9Q5D8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn2r48E9Q5D8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn2r48E9Q5D8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn2r48E9Q5D8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn2r48E9Q5D8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn2r48E9Q5D8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn2r48E9Q5D8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn2r48E9Q5D8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn2r48E9Q5D8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn2r48E9Q5D8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn2r48E9Q5D8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn2r48E9Q5D8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn2r48E9Q5D8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn2r48E9Q5D8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn2r48E9Q5D8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn2r48E9Q5D8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn2r48E9Q5D8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn2r48E9Q5D8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn2r48E9Q5D8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn2r48E9Q5D8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn2r48E9Q5D8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn2r48E9Q5D8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn2r48E9Q5D8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn2r48E9Q5D8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn2r48E9Q5D8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.8 ms