Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Susd1E9Q3H4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Susd1E9Q3H4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Susd1E9Q3H4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Susd1E9Q3H4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Susd1E9Q3H4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Susd1E9Q3H4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Susd1E9Q3H4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Susd1E9Q3H4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Susd1E9Q3H4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Susd1E9Q3H4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Susd1E9Q3H4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Susd1E9Q3H4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Susd1E9Q3H4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Susd1E9Q3H4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Susd1E9Q3H4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Susd1E9Q3H4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Susd1E9Q3H4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Susd1E9Q3H4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Susd1E9Q3H4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Susd1E9Q3H4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Susd1E9Q3H4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Susd1E9Q3H4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Susd1E9Q3H4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Susd1E9Q3H4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Susd1E9Q3H4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Susd1E9Q3H4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Susd1E9Q3H4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Susd1E9Q3H4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Susd1E9Q3H4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Susd1E9Q3H4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Susd1E9Q3H4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Susd1E9Q3H4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Susd1E9Q3H4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Susd1E9Q3H4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Susd1E9Q3H4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Susd1E9Q3H4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Susd1E9Q3H4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Susd1E9Q3H4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Susd1E9Q3H4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Susd1E9Q3H4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Susd1E9Q3H4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Susd1E9Q3H4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Susd1E9Q3H4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Susd1E9Q3H4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Susd1E9Q3H4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Susd1E9Q3H4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Susd1E9Q3H4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Susd1E9Q3H4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Susd1E9Q3H4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Susd1E9Q3H4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Susd1E9Q3H4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Susd1E9Q3H4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Susd1E9Q3H4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Susd1E9Q3H4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Susd1E9Q3H4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Susd1E9Q3H4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Susd1E9Q3H4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Susd1E9Q3H4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Susd1E9Q3H4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Susd1E9Q3H4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Susd1E9Q3H4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Susd1E9Q3H4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Susd1E9Q3H4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Susd1E9Q3H4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Susd1E9Q3H4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Susd1E9Q3H4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Susd1E9Q3H4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Susd1E9Q3H4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Susd1E9Q3H4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Susd1E9Q3H4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Susd1E9Q3H4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Susd1E9Q3H4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Susd1E9Q3H4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Susd1E9Q3H4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Susd1E9Q3H4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Susd1E9Q3H4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Susd1E9Q3H4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Susd1E9Q3H4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Susd1E9Q3H4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Susd1E9Q3H4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Susd1E9Q3H4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Susd1E9Q3H4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Susd1E9Q3H4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Susd1E9Q3H4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Susd1E9Q3H4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Susd1E9Q3H4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Susd1E9Q3H4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Susd1E9Q3H4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Susd1E9Q3H4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Susd1E9Q3H4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Susd1E9Q3H4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Susd1E9Q3H4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Susd1E9Q3H4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Susd1E9Q3H4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Susd1E9Q3H4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Susd1E9Q3H4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Susd1E9Q3H4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Susd1E9Q3H4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Susd1E9Q3H4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms