Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn1r238E9Q373 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r238E9Q373 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r238E9Q373 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r238E9Q373 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn1r238E9Q373 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn1r238E9Q373 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn1r238E9Q373 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r238E9Q373 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r238E9Q373 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r238E9Q373 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r238E9Q373 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r238E9Q373 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r238E9Q373 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r238E9Q373 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r238E9Q373 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r238E9Q373 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r238E9Q373 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r238E9Q373 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r238E9Q373 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r238E9Q373 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r238E9Q373 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r238E9Q373 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r238E9Q373 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r238E9Q373 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r238E9Q373 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn1r238E9Q373 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn1r238E9Q373 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn1r238E9Q373 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vmn1r238E9Q373 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn1r238E9Q373 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn1r238E9Q373 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn1r238E9Q373 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn1r238E9Q373 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn1r238E9Q373 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn1r238E9Q373 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn1r238E9Q373 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn1r238E9Q373 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r238E9Q373 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r238E9Q373 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r238E9Q373 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn1r238E9Q373 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn1r238E9Q373 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r238E9Q373 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r238E9Q373 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r238E9Q373 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r238E9Q373 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r238E9Q373 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r238E9Q373 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r238E9Q373 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r238E9Q373 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn1r238E9Q373 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn1r238E9Q373 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r238E9Q373 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r238E9Q373 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r238E9Q373 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r238E9Q373 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r238E9Q373 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r238E9Q373 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r238E9Q373 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r238E9Q373 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r238E9Q373 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r238E9Q373 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r238E9Q373 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r238E9Q373 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r238E9Q373 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r238E9Q373 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn1r238E9Q373 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn1r238E9Q373 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn1r238E9Q373 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r238E9Q373 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r238E9Q373 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r238E9Q373 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r238E9Q373 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r238E9Q373 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r238E9Q373 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r238E9Q373 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r238E9Q373 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r238E9Q373 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r238E9Q373 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r238E9Q373 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r238E9Q373 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r238E9Q373 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r238E9Q373 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r238E9Q373 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn1r238E9Q373 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn1r238E9Q373 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn1r238E9Q373 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r238E9Q373 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r238E9Q373 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r238E9Q373 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r238E9Q373 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r238E9Q373 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r238E9Q373 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r238E9Q373 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r238E9Q373 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r238E9Q373 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vmn1r238E9Q373 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn1r238E9Q373 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn1r238E9Q373 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms