Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krtap11-1E9Q2E9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krtap11-1E9Q2E9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krtap11-1E9Q2E9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krtap11-1E9Q2E9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krtap11-1E9Q2E9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krtap11-1E9Q2E9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krtap11-1E9Q2E9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krtap11-1E9Q2E9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krtap11-1E9Q2E9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krtap11-1E9Q2E9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krtap11-1E9Q2E9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krtap11-1E9Q2E9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krtap11-1E9Q2E9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krtap11-1E9Q2E9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krtap11-1E9Q2E9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krtap11-1E9Q2E9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Krtap11-1E9Q2E9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krtap11-1E9Q2E9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krtap11-1E9Q2E9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krtap11-1E9Q2E9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krtap11-1E9Q2E9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krtap11-1E9Q2E9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Krtap11-1E9Q2E9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krtap11-1E9Q2E9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krtap11-1E9Q2E9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krtap11-1E9Q2E9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krtap11-1E9Q2E9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krtap11-1E9Q2E9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krtap11-1E9Q2E9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krtap11-1E9Q2E9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Krtap11-1E9Q2E9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krtap11-1E9Q2E9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krtap11-1E9Q2E9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krtap11-1E9Q2E9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krtap11-1E9Q2E9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Krtap11-1E9Q2E9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krtap11-1E9Q2E9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krtap11-1E9Q2E9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krtap11-1E9Q2E9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krtap11-1E9Q2E9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krtap11-1E9Q2E9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krtap11-1E9Q2E9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Krtap11-1E9Q2E9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Krtap11-1E9Q2E9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krtap11-1E9Q2E9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krtap11-1E9Q2E9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Krtap11-1E9Q2E9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krtap11-1E9Q2E9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krtap11-1E9Q2E9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krtap11-1E9Q2E9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krtap11-1E9Q2E9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krtap11-1E9Q2E9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Krtap11-1E9Q2E9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krtap11-1E9Q2E9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krtap11-1E9Q2E9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krtap11-1E9Q2E9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krtap11-1E9Q2E9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Krtap11-1E9Q2E9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krtap11-1E9Q2E9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krtap11-1E9Q2E9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krtap11-1E9Q2E9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krtap11-1E9Q2E9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Krtap11-1E9Q2E9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krtap11-1E9Q2E9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krtap11-1E9Q2E9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krtap11-1E9Q2E9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krtap11-1E9Q2E9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krtap11-1E9Q2E9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krtap11-1E9Q2E9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krtap11-1E9Q2E9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krtap11-1E9Q2E9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krtap11-1E9Q2E9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krtap11-1E9Q2E9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krtap11-1E9Q2E9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krtap11-1E9Q2E9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krtap11-1E9Q2E9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krtap11-1E9Q2E9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krtap11-1E9Q2E9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krtap11-1E9Q2E9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krtap11-1E9Q2E9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krtap11-1E9Q2E9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krtap11-1E9Q2E9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krtap11-1E9Q2E9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krtap11-1E9Q2E9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krtap11-1E9Q2E9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krtap11-1E9Q2E9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krtap11-1E9Q2E9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krtap11-1E9Q2E9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms