Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrp3E9Q1T6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrp3E9Q1T6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrp3E9Q1T6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrp3E9Q1T6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrp3E9Q1T6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrp3E9Q1T6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrp3E9Q1T6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrp3E9Q1T6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrp3E9Q1T6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrp3E9Q1T6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrp3E9Q1T6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrp3E9Q1T6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Lrp3E9Q1T6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrp3E9Q1T6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrp3E9Q1T6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrp3E9Q1T6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrp3E9Q1T6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrp3E9Q1T6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrp3E9Q1T6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrp3E9Q1T6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrp3E9Q1T6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrp3E9Q1T6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrp3E9Q1T6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrp3E9Q1T6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrp3E9Q1T6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrp3E9Q1T6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrp3E9Q1T6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrp3E9Q1T6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrp3E9Q1T6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrp3E9Q1T6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrp3E9Q1T6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrp3E9Q1T6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrp3E9Q1T6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrp3E9Q1T6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrp3E9Q1T6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrp3E9Q1T6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrp3E9Q1T6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrp3E9Q1T6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrp3E9Q1T6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrp3E9Q1T6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrp3E9Q1T6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrp3E9Q1T6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrp3E9Q1T6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrp3E9Q1T6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrp3E9Q1T6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrp3E9Q1T6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrp3E9Q1T6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrp3E9Q1T6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrp3E9Q1T6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrp3E9Q1T6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrp3E9Q1T6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrp3E9Q1T6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrp3E9Q1T6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrp3E9Q1T6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrp3E9Q1T6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrp3E9Q1T6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrp3E9Q1T6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrp3E9Q1T6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrp3E9Q1T6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrp3E9Q1T6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrp3E9Q1T6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrp3E9Q1T6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrp3E9Q1T6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrp3E9Q1T6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrp3E9Q1T6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrp3E9Q1T6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrp3E9Q1T6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrp3E9Q1T6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrp3E9Q1T6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrp3E9Q1T6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrp3E9Q1T6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrp3E9Q1T6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrp3E9Q1T6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrp3E9Q1T6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrp3E9Q1T6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrp3E9Q1T6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrp3E9Q1T6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrp3E9Q1T6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrp3E9Q1T6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrp3E9Q1T6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrp3E9Q1T6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Lrp3E9Q1T6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrp3E9Q1T6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrp3E9Q1T6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrp3E9Q1T6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrp3E9Q1T6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrp3E9Q1T6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrp3E9Q1T6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrp3E9Q1T6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrp3E9Q1T6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrp3E9Q1T6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrp3E9Q1T6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrp3E9Q1T6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrp3E9Q1T6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrp3E9Q1T6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrp3E9Q1T6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrp3E9Q1T6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrp3E9Q1T6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrp3E9Q1T6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms